Vliv složení půdy na zachovalost genetické informace v lidském historickém kosterním materiálu

Bc. Zuzana Fajkošová

Bachelor's thesis

Influence of soil composition on conservation of genetic information in skeletal remains of ancient populations

Anotácia:

V současnosti je výzkum genetických profilů historických populací zdrojem řady podstatných informací. Stav kosterního materiálu a stav DNA v něm obsažené omezuje možnosti, které lze k výzkumu využít. Přímo interpretovatelné určení vlivu složení půdy na procesy degradace anorganické i organické složky kosti může umožnit výběr vhodnější vzorků ze souborů, potvrdit pozitivní výsledky a vysvětlit důvody neúspěšných analýz. K tomu účelu je vhodné využít relevantní informace o chování organických látek v půdě a o mechanismech degradace DNA in vitro. Metody, které je možné k determinaci vlivu půdy na DNA použít, zahrnují ohodnocení půdního prostředí a ohodnocení zachovalosti kostí a přímé stanovení kvality a kvantity přítomné DNA. Na to lze uplatnit jednotlivé parametry i holistické přístupy. Z literární rešerše vyplývá, že vhodným směrem výzkumu je omezit sběr vzorků na časově srovnatelné lokality z menšího regionu.

Abstract:

Recent trends emphasize applications of genetic methods in studies of ancient populations (for various research purposes). Degradation of skeletal material and of authentic ancient DNA present in bones limits the extent of possible usage of these techniques. Evaluation of effects of soil composition on digenesis of bone inorganic and organic matter may authenticate positive results, explain failures of applied methods and allow preferable selection of samples with high expectancy of yielding aDNA. For this objective generally known information on behavior of organic soil in soils and on mechanisms of DNA degradation in vitro may be applied with advantage. Methods estimating the influence of soil on DNA may assess soil environment and bone preservation or directly quantity and quality of aDNA. The approach may be holistic or may use substituting a relevant specific parameter for the complex system. This literature search suggests that a constructive direction of research work would be to focus only on samples from sites of comparable age and location.

Kľúčové slová

archaická DNA, diageneze, kosterní zachovalost, kvantifikace DNA, půdní vlastnosti

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 24. 5. 2010

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 21. 6. 2010
• Vedúci: doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Anthropology / Anthropology