Funkční analýzy vybraných mikroRNA na modelu kolorektálního karcinomu

Bc. Klára Šrůtová

Master's thesis

Functional analysis of selected microRNAs on the colorectal cancer model

Anotácia:

Kolorektální karcinom (CRC) je jedním z nejčastějších nádorových onemocnění v západních zemích a také v České republice . I když jsou poznatky o tomto onemocnění značně pokročilé, zatím se nedaří nalézt vhodné diagnostické, prognostické a prediktivní biomarkery. Výzkum této problematiky se v posledních letech zaměřuje na malé nekódující molekuly mikroRNA, jejichž vlastnosti odpovídají požadavkům pro využití, a jejichž deregulace byla prokázána u řady nádorových onemocnění. Cílem této práce bylo analyzovat expresi miR-135b u 125 pacientů s CRC a porovnat ji s expresí ve zdravé tkáni střev. Dále byly provedeny in vitro funkční analýzy miR-135b na stabilních buněčných liniích DLD-1, HCT-116+/+ a HCT-116-/-. Vliv miR- 135b na nádorové buňky byl analyzován na úrovni proliferace, viability, apoptózy, buněčného cyklu a migrace buněk.

Abstract:

Colorectal cancer (CRC) is one of the most frequent cancers in Western countries and also in the Czech Republic. Although the knowledge about the disease is well advanced, we still fail to find the appropriate diagnostic, prognostic and predictive biomarkers. The research on this issue in recent years is focused on small non-coding molecules called microRNAs, whose properties meet the requirements for use, and whose deregulation has been demonstrated in a number of cancers. This thesis deals with the analysis of the expression of miR-135b in 125 patients with CRC and compares it with the expression in healthy bowel tissue. There were also carried out in vitro functional analysis of miR-135b in stable cell lines DLD-1, HCT- 116+/+ and HCT-116-/-. The effect of miR-135b on tumor cells was analyzed at the level of cell proliferation, viability, apoptosis, cell cycle and cell migration.

Kľúčové slová

Kolorektální karcinom, mikroRNA, miR-135b

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2013

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 6. 6. 2013
• Vedúci: doc. RNDr. Ondřej Slabý, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Experimental Biology / Special Biology