Studium výskytu lanýže letního (Tuber aestivum Vittad.) ve vybraných oblastech severních Čech

Václav ŠŤOVÍČEK

Bakalářská práce

Study of summer truffles (Tuber aestivum Vittad.) in selected areas of northern Bohemia

Anotace:

Tuber aestivum Vitt. (lanýž letní) se stává důležitou součástí flóry některých evropských zemí a má velkou ekonomickou hodnotu. V současnosti jde v ČR o vysoce chráněný organismus, který vyžaduje pečlivé zacházení. Pro velkou spolehlivost detekce lanýže letního v mykorhizních kořenech, byla v této práci použita molekulárně genetická detekční metoda. Jde o metodu využívající polymerázovou řetězovou reakci (PCR) na jejímž základě lze zjistit, zda se ve studovaných vzorcích vyskytuje Tuber aestivum a rod Tuber za použití specifických primerů Tu1sekvF/Tu2sekvR resp. tubtubf/elytubr. Tyto primery jsou velice spolehlivé a vhodné pro studium výskytu lanýže letního (Tuber aestivum) a rodu Tuber ve vybraných oblastech severních Čech. Zástupci rodu Tuber byli zjištěni ve 12 z celkového počtu 42 vzorků. Porovnáním sekvencí 12 vzorků se sekvencemi dostupnými v genetické databázi GenBank s použitím vyhledávajícího nástroje ?BLAST?, nebyl zjištěn žádný výskyt druhu Tuber aestivum. Sekvence ze vzorků 1T, 25T, 30T se podobají druhu Tuber huidongense Vitt. a sekvence ze vzorků 3T, 4T, 10T, 15T, 18T, 24T, 28T a 42T se podobají druhu Tuber borchii Vitt. Protože podobnost sekvencí s nejpodobnějším druhem je poměrně nízká (max. 98 %), mohlo by se zde jednat o dosud neidentifikované druhy lanýžů.

Abstract:

Tuber aestivum Vitt. (summer truffle) is becoming an important part of the flora of some European countries and has great economic value. Currently in CR, it is a highly protected organism that requires careful handling. For high reliability of detection of summer truffles in mycorrhizal roots, molecular genetic detection method was used in this work. This is a polymerase chain reaction (PCR) based method which enables us to determine the occurrence of Tuber aestivum and other members of the genus Tuber in the studied samples using specific primers Tu1sekvF/Tu2sekvR and tubtubf/elytubr, respectively. These primers are very reliable and suitable for studying the occurrence of summer truffles (Tuber aestivum) and the genus Tuber in selected areas of northern Bohemia. Members of the genus Tuber were detected in 12 out of 42 samples. By comparing the sequences of 12 samples with sequences available in GenBank genetic database using the tool "BLAST", the similarity with Tuber aestivum sequences was not found. The sequence of samples 1T, 25T, 30T resemble the species Tuber huidongense Vitt. and sequences from samples 3T, 4T, 10T, 15T, 18T, 24T, 28T and 42T are similar to Tuber borchii Vitt. sequences. Since the sequence similarity with the closest species is relatively low (max. 98%), they may belong to a previously unidentified truffle species.

Klíčová slova

Tuber aestivum, detekce, severní Čechy, neidentifikované druhy lanýžů.

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 26. 4. 2012

Zveřejnit od: 31. 12. 2999

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: doc. RNDr. Milan Gryndler, CSc.

UNIVERZITA JANA EVANGELISTY PURKYNĚ V ÚSTÍ NAD LABEM

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Biologie