Kvantifikace proteinových biomarkerů metodou selected reaction monitoring

Mgr. Jakub Faktor

Bakalářská práce

Quantification of protein biomarkers using selected reaction monitoring

Abstract:

This work is focused on quantification of protein p53 by selected reaction monitoring (SRM) and ELISA. At the beginning there is a description of SRM instrumentation followed by a review of some publications presenting the results acquired by SRM method. Using data from quantification of purified p53 the limit of detection was obtained and compared for both methods. The comparison showed that SRM method has similar or even slightly better limit of detection compared to two-side ELISA. By a virtue of the results of experimental part of work, it is possible to state that SRM is utilizable for quantification of biomarkers and it has a potential to be a part of routine clinical diagnostics.

Abstract:

Táto práca je zameraná na kvantifikáciu proteínu p53 metódou selected reaction monitoring (SRM) a ELISA. V práci je popísaná inštrumentácia metódy nasledovaná zhrnutím informácií z niektorých publikácii prezentujúcich výsledky získané metódou SRM. Na základe kvantifikácie p53 bol určený limit detekcie oboch metód a bol porovnaný. Porovnaním sa zistilo, že metóda SRM má podobný limit detekcie ako ELISA, dokonca nepatrne nižší. Z výsledkov experimentálnej časti možno vyvodiť skutočnosť, že metóda SRM je využiteľná na kvantifikáciu biomarkerov a má potenciál preniknúť do rutinnej klinickej diagnostiky.

Klíčová slova

multiple reaction monitoring, selected reaction monitoring, hmotnostná spektrometria, p53, limit detekcie, ELISA, biomarker, Qtrap, trojitý kvadrupól, posttranslačné modifikácie, mutácia, kvantifikácia, mass spectrometry, limit of detection, triple quadrupole, posttranslational modification, mutation, quantification

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 17. 5. 2010

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 14. 6. 2010
• Vedoucí: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie