Taxonomická identifikace hmyzu pomocí DNA barcodingu

Jaroslav Strádal

Bachelor's thesis

Taxonomical identification of insect species using DNA barcoding

Anotácia:

Molekulární taxonomické metody založené na identifikaci druhů pomocí sekvence DNA pronikají díky technologickému pokroku už i mimo vybavené laboratoře na terénní stanice v pralesích. Nacházejí využití jak v tradiční taxonomii, kde slouží k popisu molekulárních znaků druhů, tak při studiu světové biodiverzity pro identifikaci kryptických druhů, nebo dokonce v potravinářském průmyslu při kontrole skutečného složení potravin. Jednou z těchto metod je i DNA barcoding. Cílem této práce je vysvětlení funkční podstaty DNA barcodingu, představení jeho výhod, úskalí a využití v různých oborech, především pak při odhalování kryptických druhů hmyzu. Efektivita DNA barcodingu byla otestována v praxi na termitech (Blattodea: Termitoidea), jelikož tato skupina skrývá velký počet značně uniformních druhů a DNA barcoding se zde dlouhodobě prosazuje. Vybraná sada druhů byla v laboratoři podrobena identifikaci pomocí DNA barcodingu a výsledky byly následně porovnány s klasickými identifikačními metodami využívajícími vnějších morfologických znaků.

Abstract:

Molecular taxonomic methods based upon identification of a species using a DNA sequence are becoming increasingly prominent with constant technological progress, even outside a functional laboratories at field stations in the forests. They find use not only in the traditional taxonomy, where they are used to describe the molecular features of species, but also in the study of global biodiversity, for the identification of cryptic species, or in the food industry to monitor actual composition of the food. One of these methods is the DNA barcoding. The aim of this work is to explain the functional nature of DNA barcoding, to present its advantages, pitfalls and uses in various fields, especially in the detection of cryptic insect species. The effectiveness of DNA barcoding has been tested in practice on termites (Blattodea: Termitoidea), members of this super-family are fairly uniformal and hard to discriminate so the DNA barcoding is of great use. The selected set of species was identified in the laboratories with DNA barcoding and the results were then compared with classical identification methods using external morphological features.

Kľúčové slová

DNA barcoding, molekulární taxonomie, identifikace hmyzu, Insecta, termiti

Keywords

DNA barcoding, molecular taxonomy, identification of insects, Insecta, termites

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 20. 4. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Vedúci: Ing. Jiří Synek, Ph.D.

Czech University of Life Sciences Prague

Faculty of Forestry and Wood Sciences

Bachelor programme / odbor:
Forestry / Forestry