Protisté skupiny Euglenozoa ve světle molekulární biologie a genomiky

Mgr. Kristína ZÁHONOVÁ

Disertační práce

Protists of the Euglenozoa group in the light of molecular biology and genomics

Abstract:

Euglenozoans are ultrastructurally unique organisms and sometimes recognized as one of the oldest eukaryotic lineages. In this thesis, I reviewed their molecular characteristics, which have been revealed using genomics, cell and molecular biological methods in recent years. I included four publications with my co-authorship exploring particular aspects of the biology of these organisms at the molecular level. Two publications describe peculiar features of the euglenophyte plastids. One of them illustrates for the first time the process of polyadenylation in the plastids of Euglena gracilis and secondary plastids in general. In the second paper, we described unusual characteristics of the enzyme ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase in the non-photosynthetic species Euglena longa, the closest relative of the photosynthetic E. gracilis. Two other publications include new data on trypanosomatid species. One concerns the nuclear genome of Leptomonas pyrrhocoris, a monoxenous relative of the human parasites of the genus Leishmania; I specifically contributed to understanding the genome diversity between populations of this species. Our description of an unprecedented alternative nuclear genetic code in Blastocrithidia sp. in the fourth paper illustrates how limited our knowledge about non-model organisms is. Genomics and molecular biology are powerful approaches that can bring new insights into these understudied fields of biology.

Abstract:

Euglenozoa sú ultraštruktúrne jedinečné organizmy a niekedy rozpoznávané ako jedny z najstarších eukaryotických línií. V tejto práci som popísala ich molekulárne charakteristiky, ktoré boli nadobudnuté v posledných rokoch s využitím metód genomiky, bunkovej a molekulárnej biológie. Zahrnula som štyri publikácie s mojím spoluautorstvom, ktoré skúmajú zaujímavé aspekty biológie týchto organizmov na molekulárnej úrovni. Dve publikácie popisujú zvláštne črty plastidov euglenofytov. Jedna z nich po prvýkrát ilustruje proces polyadenylácie v plastidoch Euglena gracilis a v sekundárnych plastidoch vo všeobecnosti. V druhom článku sme popísali nezvyčajné charakteristiky enzýmu ribulóza-1,5-bisfosfát karboxylázy/oxygenázy v nefotosyntetizujúcom druhu Euglena longa, ktorého najbližší príbuzný organizmus je fotosyntetizujúci druh E. gracilis. Dve ďalšie publikácie zahrňujú nové dáta o trypanozomatidoch. Jeden sa zaoberá jadrovým genómom Leptomonas pyrrhocoris, jednohostiteľského príbuzného ľudských parazitov rodu Leishmania; ja som prispela k porozumeniu genómovej diverzity medzi populáciami tohto druhu. Náš popis nevídaného alternatívneho jadrového genetického kódu u Blastocrithidia sp. v štvrtom článku poukázal na naše limitované vedomosti o nemodelových organizmoch. Genomika a molekulárna biológia sú účinné prístupy, ktoré môžu priniesť nové poznatky do týchto menej preštudovaných oblastí biológie.

Keywords

Euglenozoa, genomika, kinetoplastidi, euglenidi, plastid

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 11. 2016

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 14. 12. 2016
• Vedoucí: doc. Mgr. Marek Eliáš, Ph.D.

OSTRAVSKÁ UNIVERZITA

Přírodovědecká fakulta

Doktorský studijní program / obor:
Biologie / Biologie