Epidemiologie a patogeneze Escherichia coli

Petra HUBKOVÁ, DiS.

Bachelor's thesis

Epidemiology and pathogenesis of Escherichia coli

Abstract:

Escherichia coli je jedním z nejdůležitějších zástupců střevní mikroflóry. Podílí se na správném průběhu trávicích procesů ve střevě a vzniká tak prospěšná spolupráce mezi mikroorganismem a makroorganismem. Některé kmeny ale mohou být i patogenní. Náplní mé bakalářské práce je hlouběji se seznámit s bakterií E. coli, počínaje charakteristikou, patogenitou a patogenezí, laboratorní diagnostikou a konče klinickým obrazem onemocnění a terapií. Z epidemiologického hlediska se patogenní E. coli vyskytuje spíše sporadicky, ale v rozvojových zemích může narůstat až v endemii a to zejména z důvodu nedodržování hygieny. Popisovány jsou rezervoáry, cesty přenosu a nejznámější kauzy výskytu E. coli. V praktické části se zaměřuji na výskyt E. coli u nedonošených dětí, novorozenců a u dětí do 3 let, které jsou vyšetřovány s diagnózou průjmového onemocnění. V období od ledna 2015 do prosince 2015 bylo vyšetřeno 1518 stolic od dětí od 0 - 3 let, přičemž 25 stolic bylo pozitivních na přítomnost dyspeptického kmene E. coli, který je původcem průjmu. U 725 stolic byla prokázána jiná nepatologická i patologická flóra a u 768 stolic byl zjištěný nedyspeptický kmen E. coli, který není původcem průjmového onemocnění. Všech 1518 vzorků stolic bylo určeno klasickými metodami identifikace, jako jsou kultivace a biochemické testy (ENTEROtest, pestrá řada cukrů). K určení konkrétního sérotypu (O antigenu) E. coli byla provedena sérotypizace (antigenní analýza kmene) vyšetřovaného bakteriálního kmene metodou sklíčkové aglutinace. Na základě prokázaného sérotypu E. coli byly výsledky statisticky zpracovány a vyhodnoceny za účelem o jaký kmen E. coli se jedná.

Abstract:

Escherichia coli is one of the most important representatives of intestinal microflora. It contributes to the proper course of digestive processes in the gut, creating a beneficial cooperation between microorganism and macroorganism. But some strains may be pathogenic. The scope of my thesis is to get deeply acquainted with the E. coli bacteria, beginning with characteristics, pathogenicity and pathogenesis, laboratory diagnostics and ending with the clinical picture of the disease and therapy. From an epidemiological perspective, pathogenic E. coli appears rather sporadically, but in developing countries can grow up into endemics, especially because of the lack of hygiene. Described are reservoirs, transmission routes and the most famous cases of E. coli occurrence. In the practical part, I focus on the incidence of E. coli in preterm infants, newborns and children up to 3 years old, which are examined with a diarrheal disease diagnosis. During the period from January 2015 to December 2015, 1518 stools from children aged 0 3 years were examined, whereas 25 stools were positive for dyspeptic strains of E. coli, which is the originator of diarrhea. Different non-pathological and pathological flora was proven in 725 stools and non-dyspeptic strain of E. coli was ascertained in 768 stools, which is not the originator of diarrhea. All 1518 stools were examined using classical methods of identification, such as cultivation and biochemical tests (ENTEROtest, a wide range of sugars). To determine the specific serotype (O antigen) of E. coli, serotyping (antigenic analysis of strain) was performed on examined bacterial strain using slide agglutination method. On the basis of proven E. coli serotype, results were statistically analyzed and evaluated in order to determine the strain of E. coli.

Keywords

E. coli, patogeneze, průjmové onemocnění, sérotypizace

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 3. 5. 2016

Accessible from:: 3. 5. 2016

Thesis defence

• Supervisor: RNDr. Karel Fajfrlík, Ph.D.

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Health and Social Studies

Bachelor programme / field:
Specialization in Health Service / Zdravotní laborant