Stanovení proteinových markerů Alzheimerovy nemoci metodou tandemové hmotnostní spektrometrie

Bc. Jaromír Stráník

Master's thesis

Determination of protein markers relevant to Alzheimer’s disease by tandem mass spectrometry

Anotácia:

Cílem této diplomové práce bylo aplikovat moderní metody kapalinové chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie na vzorky cerebrálních organoidů (3-D buněčného modelového systému) ke stanovení proteinových buněčných markerů a vybraných markerů souvisejících s AN. Hladiny proteinů v organoidech odvozených z buněk pacienta s dědičnou formou Alzheimerovy nemoci byly porovnány s hladina-mi proteinů v kontrolních organoidech odvozených z buněk zdravého jedince. Jednalo se o časosběrný experiment, s analýzou organoidů v různých časových bodech kultivace (48, 76, 95, 110, 135, 160 dní). Výsledky mé práce by mohly pomoci při charakterizaci cerebrálních organoidů, jakožto nového perspektivního modelu pro studium molekulární podstaty Alzheimerovy nemoci.

Abstract:

This diploma thesis aimed to apply state-of-the-art liquid chromatography and tandem mass spectrometry techniques to cerebral organoids to determine selected protein cell markers and markers related to Alzheimer's disease. Protein levels in organoids derived from cells of a patient with a familial Alzheimer's disease were compared to protein levels in control organoids derived from cells of a healthy individual in a timelapse experiment in which organoids were collected at differ-ent time points of the cultivation. (48, 76, 95, 110, 135, 160 days). My results could possibly help with characterization of cerebral organoids, as a new promising model for studying the molecular principles of Alzheimer's disease.

Kľúčové slová

Alzheimerova nemoc, Cerebrální organoidy, LC-MS/MS, Cílená proteomika, SRM metoda, biomarkery Alzheimerovy nemoci, Alzheimer disease, Cerebral organoids, Targeted proteomics, SRM method, biomarkers of Alzheimer disease

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 1. 6. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 29. 6. 2021
• Vedúci: PharmDr. Zdeněk Spáčil, Ph.D.
• Oponent: PharmDr. Juraj Lenčo, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biochemistry / Analytical biochemistry