Computation of channels in protein molecules – Mgr. Petr Medek
Mgr. Petr Medek
Disertační práce
Computation of channels in protein molecules
Computation of channels in protein molecules
Anotace:
Dlouhodobý biochemický výzkum vlastností molekul proteinů vedl ke zjištění, že schopnost proteinu reagovat se svým okolím úzce souvisí s existencí dutin spojujících důležitou část uvnitř proteinu (aktivní místo) s povrchem proteinu. Tato dizertační práci představuje algoritmus pro geometrickou analýzu takovýchto dutin, zvaných tunely. Ve srovnání s ostatními metodami pro počítaní tunelů je navržený …víceAbstract:
Long-term biochemical research into the properties of protein molecules indicated that the reactivity of a protein is closely related to the existence of cavities connecting an important part inside the protein, the active site, with the surface of the molecule. This thesis presents an algorithm for geometrical analysis of such cavities, called channels. In comparison with other approaches to the channel …více
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 10. 2. 2010
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/yzbhb/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 27. 5. 2010
- Vedoucí: prof. Ing. Jiří Sochor, CSc.
- Oponent: doc. Dr. Ing. Ivana Kolingerová, Mgr. Alexej Kolcun, CSc.
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasarykova univerzita
Fakulta informatikyDoktorský studijní program / obor:
Informatika (čtyřleté) / Informatika
Práce na příbuzné téma
-
Zjemnění Delaunayovy triangulace molekulárních struktur
Pavel Němec -
Computation and analysis of channels in protein dynamics
Petr Beneš -
Algorithms for Detecting Pathways in Large Protein Structures and Their Ensembles
Ondřej Strnad -
Action at a Distance in Arginine Repressor and the Store-operated Calcium Channel Orai: Molecular Modeling and Simulations
Saurabh Kumar PANDEY