Analýza laterálních interakčních partnerů CD3e pomocí proximity tagging technologie

Bc. Markéta HECZKOVÁ

Diplomová práce

Analysis of CD3e lateral interaction partners using proximity tagging method

Anotace:

Diplomová práce se zaměřuje na analýzu laterálních interakčních partnerů proteinu CD3epsilon, pomocí metody proximity tagging. Využití moderních biotechnologických přístupů umožňuje prozkoumat proteinové interakce a jejich role v imunitním systému. Specificky byla použita metoda PUP-IT (pupylation based interaction tagging), která je založena na fúzi proteinu zájmu s enzymem PafA a následné modifikaci proteinů v blízkosti proteinu zájmu pomocí malého proteinu Pup, což umožňuje jejich specifické označení a identifikaci. Práce přináší nové poznatky o molekulárních interakcích proteinu CD3epsilon, což je významné pro pochopení imunitních procesů a poukazuje na další možnosti studia tohoto proteinu.

Abstract:

The diploma thesis focuses on the analysis of lateral interaction partners of the CD3epsilon protein using the proximity tagging method. The use of modern biotechnological approaches allows for the exploration of protein interactions and their roles in the immune system. Specifically, the PUP-IT method (pupylation-based interaction tagging) was used, which is based on the fusion of the protein of interest with the enzyme PafA and subsequent modification of nearby proteins using the small protein Pup, enabling their specific labeling and identification. This work provides new insights into the molecular interactions of the CD3epsilon protein, which is significant for understanding immune processes and highlights further possibilities for studying this protein.

Klíčová slova

CD3e, proximity tagging, PUP-IT, proteinové interakce, imunologie, T lymfocyty

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 30. 4. 2024

Zveřejnit od: 31. 12. 2999

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 14. 5. 2024
• Vedoucí: doc. RNDr. Michal Šimíček, Ph.D.

OSTRAVSKÁ UNIVERZITA

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie