Jícnový mikrobiom u pacientů s gastroezofageální refluxní chorobou

Bc. Erika Janckulíková

Bachelor's thesis

Esophageal microbiome in patients with gastroesophageal reflux disease

Abstract:

The esophageal mucosa is colonised by a complex microbial population. In recent studies significant changes have been showed in the composition of esophageal microflora, mainly during gastroesophageal reflux disease (GERD) compared to physiological state. GERD is a pathological condition characterised by the long-term back flow of acidic gastric contents to esophagus with specific symptoms and complications. The aim of the thesis was to summarize previous findings about the esophageal microbiome in patients with GERD and subsequently to establish the methods of biopsy specimen processing for future sequencing analyses. Uncovering the knowledge about the altering esophageal microflora depending on the pathological findings could help in the future with prediction of GERD disease progression into Barrett´s esophagus and esophageal adenocarcinoma.

Abstract:

Sliznice jícnu je osídlena komplexním souborem mikroorganismů. V nedávných studiích byly prokázány značné změny ve složení ezofageální mikroflóry, a to především při gastroezofageální refluxní chorobě (GERD) oproti fyziologickému stavu. GERD je patologický stav charakterizovaný dlouhodobým zpětným tokem kyselého žaludečního obsahu do jícnu se specifickými symptomy a komplikacemi. Cílem této práce bylo shrnout dosavadní zjištění o jícnovém mikrobiomu u pacientů s GERD a následně zavést metodiku zpracování bioptických vzorků pro budoucí sekvenační analýzy. Prohloubení poznatků o alternující mikroflóře jícnu v závislosti na patologickém nálezu by mohlo v budoucnu sloužit k predikci progrese onemocnění GERD do Barrettova jícnu a adenokarcinomu jícnu.

Kľúčové slová

jícnový mikrobiom, gastroezofageální refluxní choroba, alternace mikrobiomu, choroby asociovány s GERD, izolace nukleových kyselin, esophageal microbiome, gastroesophageal reflux disease, microbiome alternations, diseases associated with GERD, isolation of nucleic acids

Jazyk práce: Slovak

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2019

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 11. 6. 2019
• Vedúci: RNDr. Petra Bořilová Linhartová, Ph.D.
• Oponent: MUDr. Lumír Kunovský, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Applied Biochemistry / Applied Biochemistry