Analýza Plantain banánovníků pomocí průtokové cytometrie

Ludvík URDA

Bachelor's thesis

Analysis of plantain bananas using flow cytometry

Anotácia:

Předložená bakalářská práce se zabývá problematikou týkající se klasifikace Plantain banánovníků (Musa ssp.). Plantain banánovníky jsou triploidní jedlé typy banánů s genomovým složením AAB. Vznikly přirozenou hybridizací dvou planě rostoucích diploidních druhů M. acuminata a M. balbisiana. Plantainy se vyskytují převážně v Africe, kde jsou považovány za jednu z nejdůležitějších plodin pro místní obyvatelstvo. Mimo Afriku se vyskytují také v Indii, či na severu Filipín. Příbuznost Plantain banánovníků se tradičně dělí podle základních květních morfotypů do tří skupin: 1) 'French', 2) 'French Horn' a 'False Horn' a 3) 'Horn'. Pro charakterizaci banánovníků se do nedávna používaly výhradně morfo-taxonomické znaky, které však nejsou dostatečně robustní pro identifikaci některých planých druhů nebo jednotlivých jedlých typů banánovníku. Průtoková cytometrie je velmi rychlá metoda využívaná v rostlinné taxonomii. Je založena na analýze fluorescenčně obarvených částic (buněčných jader izolovaných v příslušném pufru), kdy za použití tzv. standardu, druhu o známé ploidii nebo velikosti genomu, lze rychle a snadno stanovit ploidii (nebo velikost genomu) analyzovaných druhů. Metody průtokové cytometrie bylo využito také v předkládané bakalářské práci, v jejíž praktické části byla stanovena ploidie u 102 položek banánovníků zaslaných z genové banky (ITC kolekce, Lovaň, Belgie).

Abstract:

Presented bachelor thesis deals with problems relating to the classification of Plantain bananas (Musa ssp.). Plantains are triploid edible bananas with genomic composition AAB. Plantains originated by natural hybridization of two wild diploid species M. acuminata and M. balbisiana. Plantains are widespread mainly in Africa, where they are considered as one of the most important crop for the local population. Outside Africa, they are growing in India, and the northern Philippines. Plantain bananas are traditionally classified into three groups,according basic floral morphotypes: 1) 'French', 2) 'French Horn' and 'False Horn' and 3) 'Horn'. Traditional classification of bananas is based on basic chromosome number and morpho-taxonomic descriptor. However, this classification system suffers by limited accuracy. Recently, a different types of molecular markers have been introduced into the classification of Musa species. Flow cytometry is fast and efficient method used in plant taxonomy. Flow cytometry is based on analysis of fluorescently labeled particles - plant nuclei isolated in respected buffer. This method enables estimation of ploidy level as well as estimation of genome size. In the present bachelor thesis, flow cytometry was used for ploidy level estimation in 102 banana accessions sent from the Musa Genebank ITC collection, Leuven, Belgium.

Kľúčové slová

plantain, banánovník, ploidie, průtoková cytometrie

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 1. 8. 2016

Obhajoba závěrečné práce

• Vedúci: Mgr. Eva Hřibová, Ph.D.

PALACKÝ UNIVERSITY OLOMOUC

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biology / Experimental Biology