Comprehensive Modeling Platform for Photosynthetic Organisms

Mgr. Matej Klement

Advanced ('rigorózní') thesis

Anotácia:

Modelovanie fotosyntézy je v posledných rokoch pomerne neskúmaná téma. To môže byť spôsobené zameraním biológie primárne na výskum genómu a funkcií jeho produktov. Táto skutočnosť vedie k malému počtu modelov popisujúcich správanie fotosyntézy alebo jej častí. Aj tento malý počet modelov je zle označený a preto nie je možné tieto modely kombinovať. Cieľom tejto práce je navrhnúť univerzálnu metódu označovania, vytvárania a zdieľanie fotosyntetických modelov. Obsahuje tiež popis súčasného stavu systému a jeho funkcií.

Abstract:

Photosynthesis modeling is quite neglected topic in last few years. This may be due to a primary focus of biology on the identification of genome and functions of its products. This fact has resulted to small number of models describing the behavior of photosynthesis or its parts. Even this small number of models is poorly notated and therefore can not be combined. This work aims to propose a universal method of notating, recording and sharing of photosynthetic models. It also includes a description of the current implementation of a system and its functions.

Keywords

biológia, systémová biológia, fotosyntéza, modelovanie

Jazyk práce: English

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 24. 2. 2012

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 22. 5. 2012
• Oponent: Ing. Matej Lexa, Ph.D., Ing. Jan Červený, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Informatics

Advanced ('rigorózní řízení') programme / odbor:
Applied Informatics / Applied Informatics