Vliv povrchového náboje elicitinů na schopnost přenosu lipidických látek

Mgr. Jitka Zemanová

Bakalářská práce

The role of elicitine surface charge in lipid transfer properties

Anotace:

Elicitiny jsou malé globulární proteiny o velikosti 10 kDa produkované vysoce patogenním rodem oomycet Phytophora. Členové rodu Phytophora jsou specifičtí parazité vyšších rostlin, mezi nimiž jsou i některé ekonomicky významné druhy. Elicitiny, které jsou pravděpodobně produkty genů avirulence, mají také funkci přenašečů sterolů, za což je zodpovědná silně hydrofobní kavita lokalizována v jádře proteinu. Elicitiny skládající se z 98 aminokyselin mají evolučně silně zakonzervované prvky sekundární struktury, skládají se z pěti α-helixů, jednoho antiparalelního β-skládaného listu, flexibilní Ω-smyčky a jejich terciální strukturu určují tři disulfidické můstky a tři vodíkové vazby. Podle jejich izoelektrického bodu se elicitiny dělí na kyselé α-elicitiny (pI<5) a bazické β-elicitiny (pI>7,5). Mezi β-elicitiny patří i cryptogein produkovaný oomycetou Phytophora cryptogea, která parazituje na rostlinách tabáku. Předpokládá se, že cryptogein je ligandem vysoceafinitního místa na plazmatické membráně, které iniciuje obranné mechanismy tabáku. Pomocí sady fluorescenčních měření byla analyzována schopnost vázat a přenášet sterol u mutantních forem cryptogeinu se změněným povrchovým nábojem.

Abstract:

Elicitins are small globular proteins (10 kDa) secreted by highly pathogenic genus of oomycets Phytophora. Members of genus Phytophora are specific parasites of higher plants including some economically important species. Elicitins, which are probably products of avirulent genes have highly hydrophobic cavity localized in protein core. The cavity is connected by a tunnel with protein surface and enables cryptogein to bind and transfer non-specific fatty acids and sterols. Elicitins consists of 98 amino acids and their tertiary structure is determined by five α-helixes, a double-stranded antiparallel β-sheet and a flexible Ω-loop. Tertiary structure is also supported by three disulphidic bonds and three hydrogen bonds. Elicitins can be divided into two groups according to their izoelectric point: acidic α-elicitins (pI<5) a basic β-elicitins (pI>7,5). Cryptogein belongs into group of β-elicitins secreted by oomycet Phytophora cryptogea infecting tobacco plants. Interaction of cryptogein with high-affinity binding side on plasma membrane of tobacco is involved in triggering defense mechanisms. In order to determine lipid transfer ability of recombinant mutants of cryptogein with altered global net charge, the fluorescence method in several arrays was used.

Klíčová slova

Phytophora cryptogea, cryptogein, elicitiny, povrchový náboj, elicitins, net charge

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 11. 5. 2012

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 18. 6. 2012
• Vedoucí: doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie