Dřevokazné houby městského prostředí na Ostravsku a využití molekulárních metod pro jejich determinaci

Bc. Veronika MÁCHOVÁ

Diplomová práce

Wood-decaying fungi of urban habitats in the Ostrava region and utility of molecular methods for their identification

Anotace:

Na lokalitách Vratimov a zámecký park v Paskově byla provedena inventarizace mykoflóry. V letech 2016-2017 bylo zaznamenáno celkem 185 dřevin napadených dřevokaznou houbou. Z celkového počtu 228 nálezů bylo identifikováno 34 druhů a 31 rodů dřevokazných hub. Nejčastěji vyskytujícími se druhy byly Daedaleopsis confragosa, Phellinus igniarius s. l., Bjerkandera adusta a Trametes versicolor. Zaznamenán byl výskyt nepříliš hojně až vzácně se vyskytujících druhů Neofavolus alveolaris a Perenniporia fraxinea. Zhodnocena byla efektivita jaderných markerů (ITS, SSU, LSU) ve vztahu k využití při DNA barcodingu dřevokazných hub. Nejvyšší genetické vzdálenosti (Kimura 2 parameter model) byly zaznamenány u markeru ITS a dále LSU. Nejnižší variabilita byla nalezena u markeru SSU, který byl pro DNA barcoding dřevokazných hub vyhodnocen jako nevhodný.

Abstract:

The mycoflora research was conducted in the Vratimov city and chateau park Paskov. There were found 185 trees infected by wood-decaying fungi. From the total of 228 findings there were 34 species and 31 genera of fungi identified. The most frequent species were Daedaleopsis confragosa, Phellinus igniarius s. l., Bjerkandera adusta and Trametes versicolor. The species Neofavolus alveolaris and Perenniporia fraxinea were found as less common. Three nuclear markers (ITS, SSU, LSU) were evaluated as DNA barcoding fungal markers. The highest genetic distances (Kimura 2-parameter model) were found for ITS followed by LSU marker. Marker SSU performed poorly with the lowest variability, and it is considered as unsuitable for wood-decaying fungi DNA barcoding.

Klíčová slova

DNA barcoding, genetická vzdálenost, dřevokazné houby, Vratimov, Paskov

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 23. 4. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 15. 5. 2018
• Vedoucí: doc. RNDr. Jan Ševčík, Ph.D.

OSTRAVSKÁ UNIVERZITA

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Systematická biologie a ekologie