Monitoring populací blýskáčka řepkového s využitím metod časné detekce rezistence pomocí molekulárních metod

Bc. Lucie KŘÍŽOVÁ

Diplomová práce

The early molecular detection of resistance in populations of pollen beetle

Anotace:

Práce se zabývá molekulární detekcí rezistence vůči pyretroidům u populací blýskáčka řepkového na základě genetických polymorfismů v genu VSSC tohoto škůdce. Vzorky populací blýskáčka řepkového byly sbírány v letech 2016-2018 převážně v jihozápadních Čechách. Analyzováno bylo celkem 57 populací blýskáčka řepkového s různým stupněm rezistence vůči pyretroidům. Nukleotidové mutace jednotlivých populací byly monitorovány ve dvou oblastech genu VSSC blýskáčka řepkového - DIIS4 - S5 linker/DIIS5 a DIIIS6, které se nachází ve vazebné doméně VSSC. Tyto oblasti byly amplifikovány a následně sekvenovány Sangerovou metodou. V alignmentu z výsledných sekvencí byly vyhledávány mutace. Následně byl určen vliv těchto mutací na aminokyselinovou sekvenci a posouzen efekt na výslednou konformaci VSSC proteinu.

Abstract:

The thesis deals with molecular detection of resistance in populations of pollen beetle based on genetic polymorphisms in the VSSC gene of this pest. Population samples were collected in 2016-2018 in the Czech Republic, mainly in the Southwestern Bohemian Region. A total of 57 populations of pollen beetles with different degrees of resistance were analyzed. Nucleotide mutations of populations were monitored in two parts of the VSSC gene of pollen beetles - DIIS4 - S5 linker / DIIS5 and DIIIS6 gene, which is located in the VSSC binding domain. These parts were amplified and sequenced by the Sanger method. In the alignment of final sequences, mutations were searched. After that, the effect of these mutations on the amino acid sequence was determined and the effect on the resulting VSSC protein conformation was assessed.

Klíčová slova

blýskáček řepkový, VSSC, pyretroidy, rezistence

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 4. 2019

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Tomáš Tonka, Ph.D.

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Zemědělská fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Zemědělské inženýrství / Zemědělské biotechnologie