Studium retronů u rodu Salmonella

Mgr. Lenka Pilousová, Ph.D.

Doctoral thesis

Study on retrons in Salmonella

Anotácia:

Retrony jsou bakteriální retroelementy, které nacházíme u volně žijících půdních bakterií i u významných patogenů, kam patří rod Salmonella. U tohoto rodu byly zatím objeveny dva retrony. Oba byly poprvé blíže charakterizovány v naší laboratoři a jsou předmětem studia této práce. V první části mé práce jsem se zabývala retronem St85, který produkuje msDNA a nachází se téměř u všech kmenů Salmonella enterica serovar Typhimurium (S. Typhimurium). V druhé části jsem se zabývala retronem Se72, který byl jako jediný retron kódovaný na plazmidu objeven u kmene Salmonella enterica serovar Enteritidis 2159 a neprodukuje msDNA, ale dvouřetězcovou DNA molekulu, pojmenovanou sdsDNA

Abstract:

Retrons are bacterial retroelements found either in genome of free-living soil bacteria or in genomes of important patogens as genus Salmonella. Two different retrons have been identified in this genus so far, both have been characterised in detail in our laboratory and both are further studied in this work. Retron St85 producing msDNA is ubiquitous in strains of Salmonella enterica serovar Typhimurium (S. Typhimurium) and was studied in the first part of this work. The second part of the work was focused on the only plasmid encoded retron Se72 discovered in Salmonella enterica serovar Enteritidis (S. Enteritidis) strain 2159. Retron Se72 is producing sdsDNA instead of msDNA.

Kľúčové slová

Salmonella, retron, mechanizmus iniciace reverzní transkripce

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 29. 5. 2009

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 3. 7. 2009
• Vedúci: doc. RNDr. Ivan Rychlík, Ph.D.
• Oponent: doc. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D., doc. RNDr. Hana Drahovská, PhD

Masaryk University

Faculty of Science

Doctoral programme / odbor:
Biology (4-years) / Molecular and Cellular Biology