Optimalizace molekulárně genetické analýzy genu NPR2 u pacientů s idiopatickým malým vzrůstem

Bc. Nikola GOLOVÁ

Master's thesis

Optimization of NPR2 gene molecular genetics analysis in case of patients with idiopathic short stature

Anotácia:

Malý vzrůst u dítěte může být znakem mnoha závažných onemocnění. Je popsána celá řada příčin rozvoje této poruchy včetně genetických. Ačkoliv je malý vzrůst předmětem multioborového studia, v řadě případů se nepodaří objasnit příčinu tohoto onemocnění (idiopatický malý vzrůst, ISS). Cestou optimalizace teploty annealingu primerů a složení PCR směsi byla zavedena Sangerova sekvenace kódujících oblastí genu NPR2 a jejich nejbližších intronických oblastí (+/20 nt), která splňuje všechny nároky kladené na metody užívané v klinické praxi. Rovněž byla zachycena varianta NM_003995.4(NPR2):c.1711-8dupT neznámého klinického významu u 1 z 22 pacientů s ISS (4,5 %). Protein genu NPR2 je významně zapojen do správného vývoje a funkce chondrocytů v růstových ploténkách dlouhých kostí. Odhalená varianta by mohla objasnit příčinu ISS u pacienta, avšak je zapotřebí dalšího studia k potvrzení této hypotézy.

Abstract:

Short stature in children may indicate many serious diseases. A lot causes of the development of this disorder have already been described, including genetic ones. Although short stature is the subject of a multidisciplinary study, in many cases, it is not possible to clarify the cause of this disease (Idiopathic Short Stature, ISS). Sanger sequencing of the coding regions of the NPR2 gene and their nearest intronic regions (+/- 20 nt) was set up by optimizing primers annealing temperature and the components of the PCR master mix. This method meets all the requirements for being used in clinical practice. Also, variant NM_003995.4 (NPR2): c.1711-8dupT of uncertain clinical significance was detected in 1 of 22 patients with ISS (4.5 %). The NPR2 gene protein is significantly involved in the proper development and function of chondrocytes in the growth plates of long bones. This disclosed variant could explain the cause of ISS in the patient, however further study is needed to confirm this hypothesis.

Kľúčové slová

idiopatický malý vzrůst, NPR2, Sangerovo sekvenování, natriuretický peptid, AMDM, varianta, MPS

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 20. 4. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Vedúci: Mgr. Zuzana Čapková

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biology / Molecular and Cell Biology