Charakterizace vazebných vlastností onkologicky významných transkripčních faktorů na DNA (Mgr. Václav Brázda, Ph.D. BFÚ AV ČR)

Mgr. Helena Fridrichová

Bakalářská práce

Characterization of the DNA-binding properties of transcription factors important in oncology

Anotace:

Buňky jsou vystaveny působení různých faktorů vnějšího prostředí, i látkám produkovaným jejich metabolismem. Vlivem takových faktorů dochází k poškození bází v DNA, které změní jejich párování. Pokud reparační mechanismy buňky poškozené místo neopraví, začlení se během replikace do genu jako jiná báze a způsobí vznik mutace - změní smysl daného genu. Mutace uvnitř protoonkogenů a nádorových supresorů podmiňují vznik nádorů. Za dědičné předpoklady pro vznik karcinomu prsu je zodpovědná mutace nádorového supresoru - genu BRCA1 (breast cancer 1, early onset). Proteinový produkt tohoto genu, protein BRCA1, se účastní mnoha buněčných procesů. Je zapojený do sledování poškození DNA i jeho oprav, působí proti malignímu zvratu. Má také transkripční funkci, protože se váže k DNA a svou vazbou na promotory některých genů ovlivňuje jejich expresi. Správná funkce proteinů je ovlivněna jejich množstvím v buňce a také zachováním jejich struktury. Dvojmocné ionty zinku, kobaltu a niklu můžou ovlivnit strukturu proteinu i DNA a tak změnit schopnost jejich vazby. Předmětem zkoumání této bakalářské práce je způsob, jakým různé koncentrace dvojmocných iontů ovlivňují uspořádání proteinu BRCA1 a jeho vazbu k DNA.

Abstract:

Cells are exposed to the influence of various damaging environmental factors as well as substances produced by their metabolism. These factors cause a damage of DNA bases which results in a different base pairing. If this damage is not fixed by a cell repair mechanism there is going to be the different base pair during the replication which will cause a mutation which changes the meaning of a given gene. The mutation of protooncogenes and tumor suppressor genes leads to tumorgenesis. The mutation of a tumor suppressor - BRCA1 gene (breast cancer 1, early onset) is responsible for the breast cancer inheritance. Its protein product – BRCA1 protein – is involved in various cellular processes. It is implicated in a DNA-damage sensing and a DNA-repair and thus it antagonizes cell transformation. The protein has a transcription function – it binds to DNA promoters and affects their expression. Correct function of proteins is affected by their amount in the cell as well as their proper structure. Zn2+, Co2+ and Ni2+ ions can have an effect on protein and DNA structure and can change their binding ability. The objective this thesis is to find out, how the concentration of these ions impacts the conformation of BRCA1 protein and its binding to DNA.

Klíčová slova

BRCA1, poškození DNA, vazba BRCA1-DNA, zinek, kobalt, nikl

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 11. 5. 2009

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 16. 6. 2009
• Vedoucí: doc. Mgr. Václav Brázda, Ph.D.
• Oponent: doc. Mgr. Jan Paleček, Dr. rer. nat.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie