Molekulární charakteristika ETA-konvertujících fágů izolovaných z klinických kmenů Staphylococcus aureus

Bc. Tibor Botka, Ph.D.

Master's thesis

Molecular characteristics of the ETA-converting phages isolated from clinical strains of Staphylococcus aureus

Abstract:

Diplomová práce se zabývá genomovou analýzou a molekulární charakteristikou genomu dvou dosud nepopsaných stafylokokových eta-pozitivních bakteriofágů z čeledi Siphoviridae, které byly indukovány a izolovány z klinických kmenů Staphylococcus aureus. Součástí genomu těchto bakteriofágů je gen kódující exfoliativní toxin A, který je hlavním agens při vzniku epidermolytických onemocnění. Nejčastěji jsou jimi postiženi novorozenci a děti předškolního věku. Projevy stafylokokových epidermolytických onemocnění mohou být mírné s tvorbou lokalizovaných kožních lézí (bulózní impetigo), ale i generalizované život ohrožující stavy, projevující se narušením rozsáhlých ploch epidermis s možným rozvratem homeostázy (stafylokokový syndrom opařené kůže). Vznik ETA-pozitivních kmenů Staphylococcus aureus je usnadněn možností horizontálního přenosu genu eta prostřednictvím pozitivní lyzogenní konverze.

Abstract:

This diploma thesis is focused on genomical analysis and molecular characterization of two previously undescribed staphylococcal eta-positive bacteriophages of the family Siphoviridae. These phages were induced and isolated from clinical strains of Staphylococcus aureus. Their genomes contain a gene encoding exfoliative toxin A, which is the main agent of developement of epidermolytic diseases. Newborns and young children are affected in most cases. Symptoms of staphylococcal epidermolytic diseases may be mild, when localized blisters and lesions are formed (bullous impetigo), but also generalized life‑threatening conditions may appear (staphylococcal scalded skin syndrome). It manifests itself by disruption of the large areas of the epidermis and there is also a danger of collapse of homeostasis. Origin of ETA-positive strains of Staphylococcus aureus is eased by possibility of horizontal gene transfer by positive lysogenic conversion.

Keywords

bakteriofág, exfoliativní toxin, eta gen, Staphylococcus aureus, genomová analýza, lyzogenní konverze, bacteriophage, exfoliative toxin, eta gene, genomical analysis, lysogenic conversion

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 13. 5. 2013

Thesis defence

• Date of defence: 10. 6. 2013
• Supervisor: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics