Genetická variabilita původních populací vrby šedé (Salix elaeagnos) v ČR

Bc. Lucie KLEČKOVÁ

Master's thesis

Genetic variability of native populations of Rosemary willow (Salix elaeagnos) in the Czech Republic

Abstract:

Vrba šedá (Salix elaeagnos) patří v České republice k silně ohroženým druhům. Svým výskytem se soustřeďuje pouze do oblasti Beskyd a Podbeskydské pahorkatiny a je vázána na vzácný biotop štěrkových náplavů. Tato práce se zabývala charakteristikou populací v Beskydech a stavem ohrožení druhu. Ke studiu genetické diverzity byly použity mikrosatelitní markery, ze sedmi testovaných se pro tři povedlo najít vhodné podmínky. Bylo analyzováno 71 vzorků ze čtyř populací (Morávka, Ostravice, Čeladenka a Lomná). Výsledky ukázaly nízkou klonalitu a vysokou genetickou variabilitu uvnitř populací. Analýza příbuznosti populací neprokázala žádnou výraznou strukturu v populacích, což může znamenat, že mezi populacemi dochází ke genetickému toku. Ovšem počet tří mikrosatelitů se bohužel ukázal jako nízký, pro potvrzení bude nezbytná další analýza s více mikrosatelity. Za největší ohrožení populací v Beskydech považuji stav biotopů, které jsou fragmentovány a z velké části zničeny regulací řek. Pionýrské druhy, mezi které Salix elaeagnos patří, jsou ohroženy nedostatkem disturbancí a postupující sukcesí.

Abstract:

Rosemary willow (Salix elaeagnos) belongs to endangered species of the Czech Republic. Its populations are solely concentrated in the Beskydy Mountains and its foothills and are confined to a rare biotope of gravel riverbeds. The thesis dealt with the characteristics of the natural population in the Beskydy region and the degree of threat that the species faces. Genetic diversity was studied by using microsatellite markers. The PCR conditions were optimized for three of the seven tested markers. In total, seventy-one samples collected from four different populations (i.e., populations of the Morávka, Lomná, Čeladenka, and Ostravice rivers) were analysed. My results have shown low clonality and high degree of genetic variation within individual populations. Unfortunately, I have not detected any significant population structure or relationship among populations. This might be explained either by a genetic flow among the populations, or more likely by insufficient number of used molecular markers giving biased results. Further confirmation of intra- and inter-population relationships requires a larger sample involving more microsatellites to confirm our findings. I consider the current state of biotopes the most serious threat to the Beskydy Mountains population as these biotopes are fragmented and to a great extent destroyed by the rivers having been regulated. The pioneering species, such as Salix elaeagnos are threatened by a low degree of disturbances and the ongoing succession.

Keywords

Salix elaeagnos, Moravsko-slezské Beskydy, štěrkové náplavy, mikrosatelity, conservation genetics

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 10. 5. 2013

Accessible from:: 10. 5. 2013

Thesis defence

• Date of defence: 10. 6. 2013
• Supervisor: RNDr. Radim Jan Vašut, Ph.D.

PALACKÝ UNIVERSITY IN OLOMOUC

Faculty of Science

Master programme / field:
Biology / Botany