Modelování FGFR signálních drah s využitím formálních metod

Ing. Jiří Těthal

Diplomová práce

Modelling of FGFR signalling pathways with formal methods

Anotace:

Achondroplasie je nejčastější příčina disproporcionálního trpaslictví, vznikající mutací DNA. V drtivé většině případů se mutace nachází v genu pro receptor vazivového růstového faktoru FGFR 3. Výzkum se tedy zaměřuje na signální dráhu tohoto receptoru a modelování jejích mechanismů prostřednictvím formálních metod systémové biologie. Pomocí kvalitativního frameworku GNA bylo vytvořeno několik variant této signální dráhy podle aktuálních biologických hypotéz a na nich byla poté provedena analýza dosažitelnosti zdravého a nezdravého chování vedoucího k tomuto onemocnění.

Abstract:

Achondroplasia is the most common cause of disproportionate dwarfism, resulting from DNA mutations. In most cases, the mutation is in a gene for the growth factor receptor ligament FGFR 3. Research therefore aims on the signaling pathway of this receptor and modeling its mechanisms through formal methods of systems biology. Using a qualitative framework GNA was created several variants of this signaling pathway by current biological hypotheses and they were then analyzed the availability of healthy and unhealthy behaviors leading to this disease.

Klíčová slova

Achondroplasie, receptor růstového faktoru, FGFR 3, systémové biologie, signální dráhy, GNA, Achondroplasia, growth factor receptor, FGFR 3 systems biology, signaling pathways

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 7. 1. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 11. 2. 2015
• Vedoucí: RNDr. David Šafránek, Ph.D.
• Oponent: Ing. Matej Lexa, Ph.D.

Masarykova univerzita

Fakulta informatiky

Magisterský studijní program / obor:
Aplikovaná informatika / Bioinformatika