Specifické obohacovací techniky fosfopeptidů

Mgr. Kateřina Nováková, Ph.D.

Bakalářská práce

Specific Enriching Techniques of Phosphopeptides

Anotace:

Cílem této práce byla optimalizace a studium postupů specifického obohacení fosfopeptidů po proteolytickém štěpení fosfoproteinů a před vlastní MS analýzou. Jako modelový protein byl zvolen hovězí alfa-kasein. Analýzy byly provedeny na MALDI-TOF MS. Jako nejvhodnější byla potvrzena analýza z normální MALDI destičky s matricí sDHB a separace na oxidu titaničitém, dle postupu převzatého z práce M. Larsena (Mol Cell Proteomics 2005, 4:873-886). Byly analyzovány vlastnosti postupu; vykazuje dobrou opakovatelnost i selektivitu. Dále byly studovány komerční postupy, z nichž uspokojivé výsledky poskytuje MB-IMAC Fe.

Abstract:

The purpose of this work was optimization and study of specific techniques for phosphopeptide enrichment after phosphoprotein proteolytic cleavage and before the MS analysis. As a model protein, bovine alpha-casein was chosen. Analysis was accomplished on MALDI-TOF MS instrumentation. As the most suitable analysis from normal MALDI target with matrix sDHB and separation on titanium dioxide according to original procedure adapted from M. Larsen (Mol Cell Proteomics 2005, 4:873-886) was confirmed. Procedure characteristics were analyzed; its good repeatability and selectivity has been proved. Further, commercial procedures were assayed, from which MB-IMAC Fe was found to give satisfactory results

Klíčová slova

MATRIX ASSISTATED LASER DESORPTION-IONIZATION-TIME OF FLIGHT MASS SPECTROMETRY, METAL OXIDE AFFINITY CHROMATOGRAPHY, IMMOBILIZED METAL ION AFFINITY CHROMATOGRAPHY, ENRICHEMENT, PHOSPHOPEPTIDES, TITANIUM DIOXIDE

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 24. 5. 2007

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 29. 6. 2007
• Vedoucí: doc. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Fyzika / Biofyzika