Využití molekulárně biologických metod u toxikologických testů

Barbora KOZACZKOVÁ

Bachelor's thesis

Using molecular biological methods in toxicological tests

Abstract:

Čtenáře své práce seznamuji s polutanty, poslední dobou nejčastěji sledovanými, v půdním prostředí. Představuji nejznámější půdní modelové toxikologické organismy třídy Oligochaeta, především žížalu hnojní (Eisenia fetida), na které rovněž vysvětluji princip nejznámějších testů toxicity, které jsou doplněny o konkrétní a aktuální poznatky z praxe. Cílem této práce je porovnat, jaké informace poskytují klasické (eko)toxikologické testy a čím k tomu dokáže přispět využití molekulárně biologických metod. V této práci se zabývám metodami DNA microarray, NGS a RT-qPCR,které nachází uplatnění v rámci studia genové exprese a ve výzkumu biomarkerů

Abstract:

Readers of this work are acquainted with pollutants which are most recently observed in soil environment. I present the most well-known soil regimen toxicological organisms of the class of the Oligochaeta, especially the earthworm earthworm Eisenia fetida), I explain the principle of the most well-known toxicity tests,which are supplemented by specific ones and current practice. The aim of this work is to compare what information is provided by classical (eco)toxicological tests and how can molecular biological methods contribute to this. In this work I deal with DNA microarray, NGS and RT-qPCR methods which find application in gene expression studies and biomarker research.

Keywords

polutant, Eisenia fetida, ekotoxikologické testy, RT-qPCR, DNA microarray, NGS, biomarker, toxikogenomika

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 10. 1. 2020

Accessible from:: 31. 12. 2999

Thesis defence

• Date of defence: 7. 2. 2020
• Supervisor: Mgr. Jiří Červeň

University of Ostrava

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biology / Experimental Biology