Vizualizace bakterií na povrchu imunosensorů

Mgr. Renata Šromová

Bachelor's thesis

Visualization of microbes on the immunosensing surfaces

Abstract:

Práce se zabývá porézním křemíkem jako materiálem vhodným pro konstrukci imunosensorů. Porézní křemík se vyznačuje velmi dobrými vlastnostmi, mezi které patří například velká reakční plocha nebo nízká hodnota pozadí rušící měření, v neposlední řadě také finanční nenáročnost a snadná příprava. Důležitým parametrem, který charakterizuje porézní křemík, je velikost pórů a vzdálenost mezi nimi. Tyto vlastnosti lze během výroby měnit. Podle pórů se pak křemík dělí na několik typů. Cílem práce bylo zhodnocení vlivu poréznosti na imunospecifickou vazbu bakterií. Pro experimentální část byla jako zástupce bakterií vybrána E. coli. Po její kultivaci byla ve dvou různých koncentracích vázána na připravené křemíkové úlomky modifikované silanizací a kovaletně navázanou specifickou protilátkou. Další částí práce je mikroskopování, pomocí kterého bylo provedeno vyhodnocení. Z obou vyhodnocení vyšel jako nejvhodnější povrch křemíku typ 1+. Vhodnost ostatních typů se lišila podle způsobu vyhodnocení.

Abstract:

The target of this work is to detect how the position and size of pores in silicon affects the immunospecific binding of bacteria. Porous silicon represents potentially suitable material for construction of imunosensors. Porous silicon exhibits good reaction properties such as large reaction surface and low background, which can simplify measurement. The fabrication of porous silicon is easy and inexpensive. Important parameters characterizing porous silicon include position and size of pores. According to the type of pores, silicon can be divided into a several types. In the experimental part of this thesis, the bacterium Escherichia coli was used. After cultivation the bacteria was bound on the immunospecific surface of porous silicon modified with covalently attached antibodies. Furthermore, fluorescence microscopy was used for evaluating results of this experiment. Images obtained from fluorescence microscopy and fluorescence scanning showed that the most suitable porous silicon surface is the type 1+. Suitability of other types depends on the experimental procedure used for the assay and its evaluation.

Keywords

biosensor, imunosensor, porézní křemík, Escherichia coli

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 14. 5. 2009

Thesis defence

• Date of defence: 24. 6. 2009
• Supervisor: doc. RNDr. Petr Skládal, CSc.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Applied Biochemistry / Applied Biochemistry