Molekulárně genetická analýza myelodysplastického syndromu

Kateřina BUČILOVÁ

Bachelor's thesis

Molecular genetic analysis of myelodysplastic syndrome

Abstract:

Téma mé bakalářské práce je zaměřeno na analýzu molekulárně-genetických abnormalit u myelodysplastického syndromu (MDS), který je řazen mezi hemato-onkologické choroby. MDS je heterogenní skupina onemocnění, které vzniká jako důsledek akumulace genetických a epigenetických změn v hematopoetické kmenové buňce. Přesný mechanismus vzniku MDS není dodnes zcela znám a je předmětem výzkumu. MDS se častěji vyskytuje u starších lidí (mezi 65 ? 70 lety), vzácněji se s tímto onemocněním setkáváme u mladších osob a dětí. Experimentální část mé bakalářské práce je zaměřena na vyšetření genetických změn přítomných u pacientů řazených do jedné z podskupin MDS, u kterých došlo k deleci dlouhého raménka chromozomu 5 (tzv. 5q minus syndrom). Vyšetřovací metodou byla MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification), umožňující detekci změn počtu kopií genových sekvencí. Cílem práce bylo zavést technologii MLPA pro genetickou analýzu nemocných s 5q- syndromem na Hemato-onkologické klinice LF a FN Olomouc a vyhodnocením výsledků zjistit, je-li MLPA vhodnou metodou pro detekci genetických změn u těchto pacientů. Praktická analýza nádorové DNA od 5 nemocných ukázala, že MLPA poskytne informace o některých diagnosticky a prognosticky významných genech, které se nacházejí na chromosomovém úseku 5q, a že může být u některých nemocných vhodnou doplňující metodou sloužící pro verifikaci diagnózy.

Abstract:

The topic of my bachelor thesis is focused on molecular genetic abnormalities in myelodysplastic syndrome (MDS), a hemato-oncological disorder considered as ?pre-leukemia? condition. MDS is a heterogeneous group of clonal myeloid neoplasms that arise from accumulation of genetic and/or epigenetic changes in hematopoietic stem cells and can progress to leukemia. The causes and the mechanisms of MDS development are not fully understood and are the subject of intense research. MDS is primarily a disease of the elderly, with most of the cases diagnosed between 65 ? 70 years of age; only rarely is the disease seen in younger people and in childhood. The experimental part of my bachelor thesis is aimed to the analysis of genetic alterations present in patients with one of the subtypes of MDS characterized by interstitial deletions of parts of the long arm of human chromosome 5, called 5q minus syndrome. A technique used to detect changes in gene copy number sequences was MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification). The aim of this study was to introduce MLPA analysis for the 5q minus syndrome patients followed at the Dept. of Hemato-Oncology, Faculty Hospital, Olomouc, and to evaluate MLPA suitability for the detection of copy number changes of selected genes that are implicated in the etiopathogenesis of 5q minus syndrome. Our analysis of 5 patients revealed that MLPA provides information on diagnostically and prognostically important genes that are located in 5q chromosomal segment and that it could serve as a verification approach in the diagnosis of this type of MDS.

Keywords

hematopoéza, 5q minus syndrom, MLPA

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 8. 7. 2013

Accessible from:: 8. 7. 2013

Thesis defence

• Date of defence: 26. 8. 2013
• Supervisor: RNDr. Martina Divoká

PALACKÝ UNIVERSITY IN OLOMOUC

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biology / Molecular and Cell Biology