Structure-function relationships of haloalkane dehalogenase enzymes – Mgr. Radka Chaloupková, Ph.D.
Mgr. Radka Chaloupková, Ph.D.
Doctoral thesis
Structure-function relationships of haloalkane dehalogenase enzymes
Structure-function relationships of haloalkane dehalogenase enzymes
Abstract:
Disertační práce popisuje strukturu a funkci dvou halogenalkandehalogenas: LinB z Sphingobium japonicum UT26 a DbjA z Bradyrhizobium japonicum USDA110. Práce zahrnuje expresi a purifikaci divokých typů a mutantních enzymů, jejich strukturní charakterizaci metodou cirkulárního dichroismu, měření enzymové aktivity, stanovení kinetických konstant ve stacionárním a tranzitním stavu a termodynamickou analýzu …moreAbstract:
. Z naměřených teplotních závislostí byly vypočteny diferenční aktivační parametry, a . Zjištěné termodynamické parametry naznačily možnost dvou strukturních podstat enantioselektivity DbjA. Kapitola 5 je zaměřena na pochopení strukturní podstaty enantioselektivity halogenalkandehalogenasy DbjA. Rozsáhlý screening enantioselektivity ukázal, že tento enzym vykazuje vysokou enantioselektivitu vůči bromovaným …moreAbstract:
This thesis describes the structure and function of two haloalkane dehalogenases LinB from Sphingobium japonicum UT26 and DbjA from Bradyrhizobium japonicum USDA110. The work covers mutagenesis, expression and purification of the wild type and mutant enzymes, their structural characterisation by using the method of circular dichroism spectroscopy, measurement of activity, determination of steady-state …moreAbstract:
s and the differential activation parameters, and , were determined. The thermodynamic parameters suggest the presence of two different structural bases of DbjA enantioselectivity. Chapter 5 is aimed at understanding the structural basis of enantioselectivity of haloalkane dehalogenase DbjA. Broad enantioselectivity screening showed that DbjA possess excelent enantioselectivity towards brominated esters …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 6. 11. 2008
Identifier:
https://is.muni.cz/th/lreww/
Thesis defence
- Date of defence: 1. 12. 2008
- Supervisor: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- Reader: prof. RNDr. Michaela Vorlíčková, DrSc., prof. RNDr. Marie Urbanová, CSc.
Citation record
ISO 690-compliant citation record:
CHALOUPKOVÁ, Radka. \textit{Structure-function relationships of haloalkane dehalogenase enzymes}. Online. Doctoral theses, Dissertations. Brno: Masaryk University, Faculty of Science. 2008. Available from: https://theses.cz/id/t7iar1/.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceDoctoral programme / field:
Biochemistry (4-years) / Biomolecular Chemistry
Theses on a related topic
-
Počítačové modelování enzymů
Jan Brezovský -
Využití spektroskopie elektronového cirkulárního dichroismu pro stanovení obsahu kyseliny vinné ve víně
Kateřina Žáková -
Haloalkane dehalogenase from unique plant-pathogenic bacterium Agrobacterium tumefaciens C58: Biochemical characteristics and engineering
Khomaini Hasan -
Počítačové modelování enzymů
Jan Brezovský -
A novel structurally characterized haloacid dehalogenase superfamily phosphatase from Thermococcus thioreducens with diverse substrate specificity
Petra HAVLÍČKOVÁ -
Meedium engineering of haloalkane dehalogenase catalysis: Effect of water-miscible organic solvents
Veronika Štěpánková -
Dehalogenázy - výskyt, mechanismus účinku, substrátová specifita a aplikační možnosti
Kristina NOVOTNÁ -
Počítačové modelování enzymů
Jan Brezovský