Optimalizace metody izolace genomové DNA z kvasinek a vláknitých hub s následnou real-time PCR analýzou

Bc. Kateřina Motáková

Master's thesis

Optimization of methods for the isolation of genomic DNA from yeasts and filamentous fungi with subsequent real-time PCR analysis

Abstract:

Tato práce se zabývá optimalizací izolace genomové DNA z kvasinky Saccharomyces cerevisiae a vláknité houby Penicillium chrysogenum, za účelem získání co největšího výtěžku genomové DNA. U těchto mikroorganimů znesnadňuje lýzi buňky pevná buněčná stěna. K izolaci DNA z kvasinek a vláknitých hub byly využity izolační kity, které využívají mechanickou disrupci nebo enzymatickou lýzi buněčné stěny. Pro zvýšení výtěžnosti použitých izolačních kitů byly standardní postupy modifikovány. Množství DNA bylo následně zjištěno pomocí real-time PCR analýzy.

Abstract:

This thesis focuses on optimization of genomic DNA isolation from yeast cells Saccharomyces cerevisiae and mold Penicillium chrysogenum with the purpose of gaining the highest possible amount of genomic DNA. The lysis of the cell is impeded by the hard cell wall of these microorganisms. Isolation kits that use mechanical disruption or enzymatic lysis of the cell wall were employed for DNA isolation from yeast cells and mold. To increase the gain of the isolation kits, the standard procedures were modified. The yield of DNA was then detected by real-time PCR analysis.

Keywords

Saccharomyces cerevisiae, Penicillium chrysogenum, izolace DNA, real-time PCR

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 10. 5. 2013

Thesis defence

• Date of defence: 5. 6. 2013
• Supervisor: PharmDr. Antonín Libra, Ph.D.

University of Pardubice

Faculty of Chemical Technology

Master programme / field:
Special Chemical and Biological Programmes / Analysis of Biological Materials