Detekce mutace genu VPS13B zodpovědné za syndrom uvězněných neutrofilů u vybraných plemen psů využívaných pro asistenční aktivity

Lucie Zemanová

Bakalářská práce

Detection of VPS13B gene mutation responsible for trapped neutrophil syndrome in selected dog breeds used for assistance activities

Anotace:

Tato bakalářská práce na téma Detekce mutace genu VPS13B zodpovědné za syndrom uvězněných neutrofilů u vybraných plemen psů využívaných pro asistenční aktivity začíná literární rešerší dané problematiky a následně pokračuje experimentální částí, která byla provedena na katedře genetiky a šlechtění.V literární rešerši je majoritní část zaměřena na Syndrom uvězněných neutrofilů a na Cohenův syndrom. Oba tyto syndromy jsou způsobeny mutací stejného genu a z tohoto důvodu je pes vhodným genetickým modelem pro výzkum lidského onemocnění. Z literární rešerše je jednoznačné, že Syndrom uvězněných neutrofilů je autozomálně recesivní onemocnění a je způsobeno deleční mutací 4 bází (GTTT) na 13. chromozomu v exonu 19. Tato mutace se objevuje pouze u plemene border kolie. Syndrom uvězněných neutrofilů způsobuje velmi závažné poruchy jedinců, pro které je ve většině případů toto onemocnění letální. Pokud jedinci s touto mutací přežijí první týdny života, žijí pouze velmi krátký a nekvalitní život. Trpí průjmy, horečkami, zvracením a také mají typické fretkoidní protažené tlamy.Experimentální část je zaměřena na izolaci DNA z bukálních stěrů jedinců plemen border kolie, zlatý retrívr, labradorský retrívr a Nova Scotia duck tolling retrívr, vytvoření PCR markerů a následnou sekvenaci získaných PCR amplikonů. Výsledky experimentální části potvrdily hypotézy, že kauzální mutace je ovlivněna plemennou příslušností a lze ji snadno identifikovat sekvenací PCR amplikonů.

Abstract:

This bachelor thesis Detection of VPS13B gene mutation responsible for Trapped neutrophil syndrome in selected dog breeds used for assistance activities starts with theoretical part and continue with experimental part, which had done in Department of genetics and breeding.The theoretical part is focused on Trapped neutrophil syndrome and Cohen syndrome. Both of theese syndromes are caused by mutation of same gene and this is the reason, why a dog is a suitable genetic model for human disease research. Based on the theoretical part is obvious that Trapped neutrophil syndrome is a autosomal recessive genetic disease and is caused by deletion of 4 bases (GTTT) on 13th chromosome in 19th exon. This mutation is only in border collie breed. The Trapped neutrophil syndrome causes very serious problems and for individuals theese problems may be letal. If they survive, they have a very poor quality life. They have diarrhoea, pyrexia, vomite and have a typical facial ferret-like snout.The experimental part is focused on isolation DNA from buccal mucosa of border collie breed, golden retriever, labrador retriever and Nova Scotia duck tolling retriever, than it is focused on design PCR markers and sequencing PCR amplicons.The experimental results had confirmed hypothesis that the causal mutation is affected by pedigree and it is easy to identificate it by sequencing PCR amplicons.

Klíčová slova

pes domácí, Canis lupus f. familiaris, Syndrom uvězněných neutrofilů, VPS13B, mutace, PCR, sekvenace

Keywords

dog, Canis lupus f. familiaris, Trapped neutrophil syndrome, VPS13B, mutation, PCR, sequencing

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 4. 2016

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: doc. Dr. Ing. Pavel Vejl

Česká zemědělská univerzita v Praze

Fakulta agrobiologie, potravinových a přírodních zdrojů

Bakalářský studijní program / obor:
Zootechnika / Zoorehabilitace a asistenční aktivity se zvířaty