Charakterizace histonových variant H2A.Z v procesu obranného primingu

Bc. Jaroslav Perdoch

Bakalářská práce

Characterization of histone variants H2A.Z in the process of defense priming

Anotace:

Regulace eukaryotického chromatinu závisí na interakci mezi mnoha epigenetickými faktory, včetně histonových modifikací, DNA metylací a inkorporací histonových variant. Jedním z příkladů inkorporace histonové varianty je nahrazení kanonického histonu H2A histonovou variantou H2A.Z. Již dříve bylo prokázáno, že histon H2A.Z má důležitou roli při transkripci. Nejen díky této roli, má inkorporace H2A.Z důležitou funkci při vývoji a imunitní odpovědi rostliny. V této práci byly naklonovány geny HTA9 a HTA11, které jsou zodpovědné za expresi histonu H2A.Z. Amplifikované geny byly vloženy do destinačního vektoru pomocí Gateway klonování a poté byl expresní klon vkládán do Agrobacterium tumefaciens. Po infiltraci Arabidopsis thaliana a Nicotiana benthamiana byla exprese genů ověřena pomocí reverzní transkripce, která ukázala úspěšné vložení genů do obou rostlin.

Abstract:

The regulation of eukaryotic chromatin depends on the interactions between many epigenetic factors, including histone modifications, DNA methylation and the incorporation of histone variants. One example of histone variant incorporation is the replacement of canonical histone H2A with the histone variant H2A.Z. Histone H2A.Z has previously been shown to play an important role in transcription. Not only because of this role, H2A.Z incorporation has an important function in plant development and immune response. In this thesis, the HTA9 and HTA11 genes, which are responsible for the expression of histone H2A.Z, were cloned. The amplified genes were inserted into the destination vector by Gateway cloning and then the expression clone was inserted into Agrobacterium tumefaciens. After infiltration of Arabidopsis thaliana and Nicotiana benthamiana, were gene expression verified by reverse transcription, which showed successful gene insertion into both plants.

Klíčová slova

Agrobacterium tumefaciens, Arabidopsis thaliana, histon H2A.Z, Nicotiana benthamiana, posttranslační modifikace, histone H2A.Z, post-translational modifications

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 19. 5. 2022

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 20. 6. 2022
• Vedoucí: doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Tomáš Brom

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Aplikovaná biochemie