Charakterizace buněčného složení v mozkových organoidech

Bc. Veronika Mikulíková

Bakalářská práce

Characterization of cell composition in cerebral organoids

Anotace:

Alzheimerova demence je nevyléčitelné neurodegenerativní onemocnění postihující populaci nad 65 let. Tato bakalářská práce se zabývá charakterizací buněčného složení cerebrálních organoidů – 3D buněčných modelů mozkové tkáně hojně využívaných při studiu Alzheimerovy demence. Komplikací při jejich používání je jejich velká variabilita ve velikosti a buněčném složení. V rámci práce byla provedena optimalizace protokolu pro disociaci organoidů porovnáním tří disociačních enzymů (papain, akutasa, kolagenasa P) a dvou protilátek pro značení astrocytů pro jejich roztřízení metodou FACS. Dále bylo kvůli nedostatečnému štěpení buněk trypsinem ovlivňujícím proteomickou analýzu testováno odsolení vzorku. Optimalizace disociace organoidů, jejich rozdělení a analýza jednotlivých buněčných populací může pomoci posunout výzkum Alzheimerovy nemoci dopředu.

Abstract:

Alzheimer´s disease is an incurable neurogenerative disease affecting the population older than 65 years of age. This bachelor thesis aims to characterize the cell composition of cerebral organoids – 3D cell models of the human brain commonly used in research on Alzheimer´s disease. Their main drawback is their significant variability in size and cell composition. The comparison of cerebral organoid dissociation protocols using three different enzymes (papain, accutase, colagenase P) and staining for FACS with two different astrocyte antibodies was performed. Furthermore, desalting of the sample had been tested because of insufficient protein trypsinization influencing proteomics analysis. Optimization of organoid dissociation, division and cell type analysis can help move forward the research of Alzheimer’s disease.

Klíčová slova

Alzheimerova nemoc, cerebrální organoidy, SRM metoda, hmotnostní spektrometrie, disociace cerebrálních organoidů, Alzheimer´s disease, cerebral organoids, SRM method, mass spectrometry, cerebral organoid dissociation

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 19. 5. 2022

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 17. 6. 2022
• Vedoucí: PharmDr. Zdeněk Spáčil, Ph.D.
• Oponent: doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie