Vliv energetického substrátu a stresových podmínek na expresi genu p28 u bakterie Acidithiobacillus ferrooxidans

Bc. Jan Matějíček

Bakalářská práce

Influence of energy substrate and stress conditions on p28 gene expression in Acidithiobacillus ferrooxidans

Anotace:

Rhodanasy jsou enzymy, vyskytující se téměř ve všech organismech od bakterií až po člověka. Jsou to enzymy patřící do skupiny thiosíran:kyanidsulfurtransferas. Jejich základní funkce je štěpení vazby mezi dvěma atomy síry vyskytující se v thiosíranu za tvorby síry a siřičitanu. Jedním z proteinů patřících do skupiny rhodanas je i protein P28. Na základě bioinformatické analýzy byly předběžně navrženy potenciální funkce proteinu P28. Cílem této práce bylo sledování hladiny transkriptu genu p28 u kultur A. ferrooxidans během růstu na různých substrátech a během různých stresových podmínek. Získané výsledky by měly přispět k objasnění skutečné biologické funkce proteinu P28 u této bakterie.

Abstract:

Rhodaneses are enzymes occurring in almost all organisms from bacteria to humans. They are enzymes, which belongs to the group of thiosulfate:sulfurtransferases. Their basic function is to cleavage the bond between two sulfur atoms present in thiosulfate to form sulfur and sulfite. One of the proteins is also known as protein P28. Based on bioinformatics, a possible function of the protein P28 has been suggested. The aim of this study was to investigate the gene transcript levels of p28 in cultures of A. ferrooxidans during growth on different substrates and during various stress conditions. The results should help to clarify the true biological function of P28 protein in this bacterium.

Klíčová slova

Acidithiobacillus ferrooxidans, rhodanasa, p28, transkripce, qPCR, rhodanese, transcription

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 5. 2016

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 8. 2. 2017
• Vedoucí: Mgr. Jiří Kučera, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie