Počítačové modelování interakcí lektinů a sacharidů – Bc. Jan Ryška
Bc. Jan Ryška
Master's thesis
Počítačové modelování interakcí lektinů a sacharidů
Computational modeling of lectin-saccharide interactions
Abstract:
Interakce mezi proteiny a sacharidy hrají klíčovou roli v mnoha biologických procesech jako je například odstraňování glykoproteinů z krevního oběhu, buněčné rozpoznávání, interakce buněk imunitního systému nebo nádorové bujení a tvorba metastáz. Tato práce zkoumá možnosti studia interakcí mezi lektiny a sacharidy pomocí metod molekulového modelování. Bylo zjištěno, že testované programy pro molekulové …moreAbstract:
Lectin-saccharide recognition is a crucial step in many biological processes such as clearance of glycoproteins from the circulatory system, cell-cell recognition, cell interactions in the immune system as well as pathological processes like metastasis. In this study, lectin-saccharide interactions were characterised by tools of molecular modeling such as molecular docking, molecular dynamics and binding …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 19. 5. 2014
Identifier:
https://is.muni.cz/th/pwd02/
Thesis defence
- Date of defence: 5. 2. 2015
- Supervisor: doc. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceMaster programme / field:
Biochemistry / Biomolecular Chemistry
Theses on a related topic
-
Molekulová dynamika a výpočty volných energii mono a di-nukleotidových analogů s potenciálním antibiotickým účinkem
Hana Zigová -
Výpočty volných energií konformačních změn vybraných fragmentů nukleových kyselin
Barbora Benešová -
Použití metod pro výpočet volných energií k studiu biomolekulárních procesů
Ivo Kabelka -
Nové metody výpočtů volných energií pro studium interakcí protein-ligand
Daniela Toulcová -
Výpočet interakční energie amfifilních peptidů
Daniel Jaroň -
Výpočet väzobného profilu volnej energie formovania proteínových dimérov.
Ján Tungli -
Stanovení volné povrchové energie vybraných pevných látek metodou sedící kapky
Hynek Ondráček -
Design of new bioactive molecules using deep generators and molecular docking
Michal Punčochář