Genetická analýza zbarvení u huculských koní zařazených do genetického zdroje

Bc. Alžběta Karbusická

Master's thesis

Genetic analysis of coat colour in Hucul horses included in Genetics Resources of Animals in the Czech Republic

Anotácia:

V rámci této práce jsme se věnovali genům MC1R, ASIP a TBX3 na vzorku 118 klisen zařazených v genetických zdrojích České Republiky. Záměrem bylo určit genetickou strukturu klisen a analyzovat fenotypová data v porovnání s genotypem a určit případné odlišnosti. Genetická analýza prokázala rovnovážný stav u všech alel (HW pro ASIP P = 0,0,9360; pro MC1R P = 0,1661 a pro TBX3 P = 0,4434). Frekvence alel byla následující, řazeno sestupně: E (0,6780), A (0,5254), a (0,4746), d2 (0,4323), d1 (0,3542), e (0,3220) a D (0,2135). Nejčastějším genotypem byl AaEed1d2 a AaEEd1d2. V populaci byly velmi málo, nebo zcela chyběly genotypy na základě recesivních homozygotů v základních genech, také jsme neidentifikovali žádného jedince s genotypem AaEed1d1. Prokázali jsme závislost genotypu v rámci genu TBX3 s primitivními znaky, čímž jsme potvrdili předešlé práce jiných autorů tvrzení jiných autorů. Alela D je vždy spojována s výskytem primitivních znaků, avšak primitivní znaky se vyskytují i bez alely D v souvislosti s alelou d1. Genotyp d2d2 je spojován s fenotypem bez primitivních znaků nebo u kterého nelze určit, zda jedinec tyto znaky nese nebo ne.

Abstract:

In this work, MC1R, ASIP and TBX3 gene were tested on a sample of 118 Hucul horse mares included in Genetic Resources of Animals in the Czech Republic. We want to determine the genetic structure of mares and to analyse phenotypic data compared to the genotype and to identify possible differences between it. Genetic analysis showed a solid state for all alleles (HW for ASIP P = 0.9360, for MC1R P = 0.1661 and for TBX3 P = 0.4444). The frequency of the allele was as follows: E (0.6780), A (0.5254), and (0.4746), d2 (0.4323), d1 (0.3542), e (0.3220) D (0.2135). The most common genotype was AaEed1d2 and AaEEd1d2. There were very few or no genotypes based on recessive homozygotes in the genes of basic coat colours in the population, we didn´t identify any individual with genotype AaEed1d1. We have publicised genotype dependence within the TBX3 gene with primitive markings, confirming the previous work of other. Alele D was always associated with the occurrence of primitive markings, but primitive markings occur even without allele D in coincidence with the d1 allele. The d2d2 genotype is associated with a phenotype without primitive markings, or with phenotype where we can´t say if the horse has primitive markings or not.

Kľúčové slová

ASIP, MC1R, TBX3, Hucul, zbarvení, primitivní znaky

Keywords

ASIP, MC1R, TBX3, Hucul horse, Primitive markings, coat colour

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 28. 4. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Vedúci: prof. Ing. Tomáš Urban, Ph.D.

Mendel University in Brno

Faculty of AgriSciences

Master programme / odbor:
Animal Breeding / Animal Biotechnology