Studium dlouhých nekódujících RNA u pacientů s multiformním glioblastomem

Bc. Romana Bútová

Master's thesis

Study of long non-coding RNAs in glioblastoma multiforme patients

Abstract:

Glioblastoma multiforme (GBM) is the most malignant intracranial tumor with a survival median of 14,6 months after stated diagnosis. The reason of such an unfavourable prognosis is its very frequent resistance to conventional therapy and early disease reccurance. One of the most important gene expression regulators with key role in formation and progression of tumor disease, including GBM, are long non-coding RNA (lncRNAs). Several recent studies have already described dysregulated level of lncRNA in GBM tissue, both in comparison with non-tumor control tissues and low-grade gliomas. At the same time, some of these lncRNAs have been described in association with overall survival in patients with GBM. More detailed study of lncRNA in GBM could determinate not only another diagnostic, prognostic and predictive markers, but new potential therapeutic targets for this disease as well. The main aim of this diploma thesis is the high-throughput analysis of lncRNA in GBM and non-tumor control tissues obtained from the patients with pharmacoresistant epilepsy through next-gene sequencing technology, and subsequent determination of specific expression model of lncRNA in GBM. At the same time, such lncRNA could become potential diagnostic markers and therapeutic targets.

Abstract:

Multiformní glioblastom (GBM) je nejmalígnejší intrakraniální nádor s mediánem přežití 14,6 měsíců od stanovení diagnózy. Důvodem takto nepříznivé prognózy je jeho velmi často se vyskytující rezistence vůči konvenční terapii a včasná recidiva onemocnění. Jedním z významných regulátorů genové exprese s klíčovou rolí ve vzniku a progresi nádorových onemocnění, včetně GBM, jsou dlouhé nekódující RNA (lncRNA). Několik recentních studií již popsalo deregulované hladiny lncRNA v GBM tkáni, a to jak ve srovnání s nenádorovými kontrolními tkáněmi, tak i ve srovnání s gliomy s nižším stupněm malignity. Zároveň byly některé tyto lncRNA popsány jako asociované s celkovým přežitím u pacientů s GBM. Detailnější studium lncRNA u GBM by tak mohlo odhalit nejen další diagnostické, prognostické a prediktivní markery, ale také nové potenciální terapeutické cíle u tohoto onemocnění. Hlavním cílem diplomové práce bylo provedení globální expresní analýzy lncRNA v GBM a nenádorových kontrolních tkáních získaných od pacientů s farmakorezistentních epilepsií pomocí technologie sekvenování nové generace (NGS) a následné stanovení specifického expresního vzoru lncRNA u GBM. Tyto lncRNA by se tak mohly stát potenciálními diagnostickými markery a zároveň terapeutickými cíli.

Keywords

multiformní glioblastom, dlouhé nekódující RNA, sekvenování nové generace, glioblastoma multiforme, long non-coding RNA, next-gene sequencing

Language used: Slovak

Date on which the thesis was submitted / produced: 16. 5. 2018

Thesis defence

• Date of defence: 4. 6. 2018
• Supervisor: doc. RNDr. Ondřej Slabý, Ph.D.
• Reader: doc. MUDr. Leoš Křen, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Biochemistry / Analytical Biochemistry