Studium biomechaniky buněk s použitím AFM nanoindentace

Bc. Zuzana Bertová

Diplomová práce

Cell biomechanics sutdied by AFM nanoindentation

Abstract:

This diploma thesis deals with the study of cell stiffness characterized by Young’s modulus of tumor cell line MCF7 using the AFM nanoindentation method. The effect of probe tip geometry and the relative force setpoint on the Young's modulus obtained was analyzed. The obtained force curves were processed in different evaluation software and using different fit models. After the measurement was optimized, the influence of the number of passages on the stiffness of the MCF7 cell line as well as the action of the cytokinin TGFβ1 on the Young's modulus was studied. The dependence of the pointwise modulus on the indentation depth of the control cells of the MCF7 cell line and after the cytokinin TGFβ1 was also investigated. In the cells of the MCF7 cell line, the influence of the number of passages on the results of Young's modulus of elasticity was not manifested, but the impact of cytokinin TGFβ1 on the stiffness of the MCF7 cell line was demonstrated.

Abstract:

Táto diplomová práca sa zaoberá štúdiom tuhosti buniek charakterizovanej Youngovým modulom pružnosti nádorovej bunkovej línie MCF7 pomocou metódy AFM nanoindentácie. Bol analyzovaný vplyv geometrie hrotu próby a veľkosti maximálnej pôsobiacej sily v meraní na získané hodnoty Youngovho modulu pružnosti. Získané silové krivky boli spracované v rôznych vyhodnocovacích softvéroch a za použitia rozličných modelov preloženia. Po optimalizácii merania bol študovaný vplyv počtu pasáží na tuhosť buniek bunkovej línie MCF7 a pôsobenie cytokinínu TGFβ1 na výsledné hodnoty Youngovho modulu pružnosti. Skúmaná bola tiež závislosť parciálneho Youngovho modulu pružnosti na hĺbke indentácie u kontrolných buniek bunkovej línie MCF7 a po pôsobení cytokinínu TGFβ1. U buniek bunkovej línie MCF7 sa neprejavil vplyv počtu pasáží na výsledné hodnoty Youngovho modulu pružnosti, bol však preukázaný účinok cytokinínu TGFβ1 na tuhosť buniek bunkovej línie MCF7.

Klíčová slova

AFM, mikroskopie atomárních sil, nanoindentace, rakovina prsu, MCF7, Youngův modul pružnosti, tuhost, AtomicJ, mikroskopia atomárnych síl, nanoindentácia, rakovina prsníku, Youngov modul pružnosti, atomic force microscopy, nanoindentation, breast cancer, Young’s modulus, stiffness

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2019

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 6. 6. 2019
• Vedoucí: Mgr. Jan Přibyl, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biochemie / Bioanalytik - odborný pracovník v laboratorních metodách