Regulace bakteriálního metabolismu proteinem FNR a jeho homology

Bc. Martina Ťapáková

Bachelor's thesis

Regulation of bacterial metabolism by the FNR protein and its homologs

Abstract:

This bachelor thesis is focused on the Fnr protein and its influence on bacterial metabolism. The theoretical part describes its structure, mechanism, and occurrence of the Fnr/Crp family homologous proteins. In the experimental part we have studied the influence of the FnrP protein of the soil bacterium Paracoccus denitrificans on the activity of terminal oxidases and on the responses to a methyl viologen-induced oxidative stress. The activity of chinol oxidase ba3 was found not to be increased either in the a wild-type or in a FnrP-deficient strain.

Abstract:

Táto bakalárska práca sa zaoberá proteínom Fnr a jeho dopadom na metabolizmus baktérií. V teoretickej časti je popísaná jeho štruktúra, mechanizmus pôsobenia a výskyt homológnych foriem z rodiny Fnr/Crp u rôznych zástupcov bakteriálnej ríše. V experimentálnej časti bol skúmaný vplyv FnrP proteínu pôdnej baktérie Paracoccus denitrificans na aktivitu terminálnych oxidáz a na odozvu na oxidačný stres vyvolaný metylviologénom. Zvýšená aktivita chinol oxidázy ba3 nebola preukázaná pri divom ani pri FnrP-deficientnom kmeni.

Kľúčové slová

Fnr, FnrP, Fe-S klaster, rodina Crp/Fnr, aeróbny metabolizmus, anaeróbny metabolizmus, O2, teminálne oxidázy, oxygraf, ampérometria, Fe-S cluster, Crp/Fnr family, aerobic metabolism, anaerobic metabolism, terminal oxidases, oxygraph, amperometry

Jazyk práce: Slovak

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 12. 5. 2016

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 1. 6. 2016
• Vedúci: prof. RNDr. Igor Kučera, DrSc.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Applied Biochemistry / Applied Biochemistry