Phormidium sensu lato v prameništích a horních tocích Vizovické vrchoviny

Adéla SMOLÍKOVÁ

Diplomová práce

Phormidium sensu lato in springs and brooks of the Vizovice Highlands

Anotace:

Vizovická vrchovina zaujímá značnou část jihovýchodní Moravy a nachází se zde významné prameniště. V rámci diplomové práce se zaměřila na čtyři toky (Vlára, Smolinka, Tichovský a Vysokopolský potok), ve kterých jsem sledovala diverzitu vláknité sinice rodu Phormidium sensu lato, která patří taxonomicky mezi nejobtížnější rod sinic. Vzorky jsem odebrala v srpnu roku 2019 z vody, břehu a blízké půdy vždy u pramene, před a za první obcí, jimiž tok protékal a zpracovala je v algologické laboratoři. U izolovaných kmenů jsem zhodnotila morfologii, ekologii a provedla molekulární analýzy (16S rRNA gen, MALDI-TOF, sekundární struktury ITS). Prokázala jsem, že velký vliv na výskyt této sinice má teplota, pH, konduktivita vody i množství dostupných živin. Kromě rodů Phormidium, Microcoleus a Kamptonema se mi podařilo izolovat rod Ancylothrix, který byl nalezen zatím pouze v Brazílii. Na základě molekulárních odlišností navrhuji popis nového rodu Pseudoancylothrix. Ukázalo se, že molekulární analýzy 16S rRNA genu se zdají být vhodným nástrojem pro studium taxonomie sinic v rámci polyfázového přístupu. Navíc proteomická analýza MALDI-TOF i sekundární struktury ITS dokážou dobře rozlišit i vnitrodruhovou variabilitu a je možné je použít při rozsáhlejších taxonomických studiích.

Abstract:

The Vizovice Highlands form large part of southeastern Moravia and there is an important springs. Within this thesis i focused on four streams (Vlára, Smolinka, Tichovský and Vysokopolský stream), in which we observed the diversity of filamentous cynobacteria of the genus Phormidium sensu lato, which is taxonomically one of the most difficult genera of cyanobacteria. In august 2019, i collected samples from the water, shore and nearby soil, always at the spring, in front of and behind the first village through which the stream flowed, and processed them in the algological laboratory. Morphology, ecology and molecular analysis (16S rRNA gene, MALDI-TOF, ITS secondary structures) were evaluated in isolated strains. I confirmed that temperature, pH, water conductivity and the amount of available nutrients have a great influence on the occurrence of this cyanobacteria. In addition to the genera Phormidium, Microcoleus and Kamptonema, i isolated the genus Ancylothrix, which has been found only in Brazil. Based on molecular differences, I propose a desription of a new genus Pseudoancylothrix. Moleuclar analysis of the 16S rRNA gene have been shown to be a suitable tool for studying cyanobacterial taxonomy within a polyphasic approach. In addition, proteomic analysis MALDI-TOF and the secondary structure ITS can well distinguish intraspecific variability and can be used in larger taxonomic studies.

Klíčová slova

sinice, nomenklatura, determinace, Phormidium, MALDI-TOF, 16S rRNA, Microcoleus, ITS

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 11. 8. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: doc. RNDr. Petr Hašler, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Hydrobiologie