Návrh regulačných sietí z predchádzajúcich znalostí

Bc. Patrik Paľovčík

Bakalářská práce

Designing regulatory networks from prior knowledge

Abstract:

This thesis focuses on creating gene regulatory networks from various sources related to regulations between genes. The thesis includes the development of a Python library and command-line interface, through which information about gene regulations can be obtained. All the data used in the thesis is aggregated from existing databases, carefully selected to cover various types of data sources on regulations.

Abstract:

Táto práca sa venuje vytváraniu génových regulačných sietí z rôznych typov zdrojov týkajúcich sa regulácií medzi génmi. V práci je vytvorená knižnica v jazyku Python a rozhranie z terminálu, pomocou ktorých je možné zisťovať informácie ohľadom génových regulácií. Všetky dáta, z ktorých práca čerpá, sú združené z už existujúcich databáz, ktoré boli vyberané tak, aby pokrývali rôzne typy zdrojov dát o reguláciách.

Klíčová slova

regulácia génovej expresie, génové regulačné siete, Python, systémová biológia, dátová veda

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 19. 12. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 16. 2. 2024
• Vedoucí: RNDr. Samuel Pastva, Ph.D.
• Oponent: RNDr. Eva Šmijáková

Masarykova univerzita

Fakulta informatiky

Bakalářský studijní program / obor:
Informatika / Informatika