Metody algoritmické delimitace druhů na základě mitochondriálních DNA sekvencí (Coleoptera: Lycidae)

Jakub RIEMEL

Bachelor's thesis

The methods of mtDNA-based species delimitation in net-winged beetles (Coleoptera: Lycidae)

Abstract:

Teoretická část této práce se zaměřuje na seznámení se s fenoménem mimikry. Jsou zde uvedeny základní charakteristiky této interakce včetně nejběžnějších typů mimikry. Dále jsou rozvedeny hypotézy zabývající se příčinou vzniku nedokonalé mimikry jako nejlepší adaptace v určitém prostředí. Závěrečná pasáž teoretické části je věnována odpovědi predátorů na vzájemnou podobnost organismů, modelové skupině této práce (Coleoptera: Lycidae) a mimetické antipredační ochraně u této čeledi. Praktická část se zabývá studiem mimikry u vybraného rodu Cladophorus čeledi Lycidae. Je zde využita fylogenetická analýza založená na mitochondriálním markeru cox1. Metodou maximum likelihood byl následně vytvořen fylogenetický strom tohoto rodu. Vyskytující se aposematické vzory u rodu Cladophorus jsou diskutovány na základě vzájemné příbuznosti a druhové diverzity v oblastech výskytu. Pro důkladnější prozkoumání vyskytujících se mimetických vzorů je nutné studovat všechny interagující skupiny podílející se na vývoji mimikry v daných geografických oblastech.

Abstract:

Theoretical part of this thesis focuses on mimicry phenomenon. Basic characteristics of this interaction are presented, including the most common types of mimicry. Furthermore, hypotheses reviewing the cause of imperfect mimicry as the best adaptation in a certain environment are discussed. The final part of the theoretical part deals with the predator's response to the similarity of organisms, the model group of this study (Coleoptera: Lycidae) and the mimetic antipredation strategy in this family. The practical part is focused on mimicry in selected Lycid genus Cladophorus. Phylogenetic hypothesis inferred in the study is based on mitochondrial marker cox1. Subsequently, the phylogenetic tree of this genus was created by the maximum likelihood method. Occurring aposematic patterns in the genus Cladophorus are discussed on the basis of mutual relation between species and species diversity in the areas of occurrence. In order to explore more closely the present protective coloration, it is necessary to study all interacting groups involved in the development of mimicry in the given geographical areas.

Keywords

mimikry, cox1, aposematické zbarvení, Nová Guinea, varovný signál, Cladophorus

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 13. 5. 2019

Thesis defence

• Supervisor: prof. Ing. Ladislav Bocák, Ph.D.

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biochemistry / Biotechnology and Gene Engineering