Charakterizace nového hypotetického lektinu z Ixodes ricinus

Bc. Kateřina Bezděková

Diplomová práce

Characterization of new hypothetical lectin from Ixodes ricinus

Anotace:

Lektiny patří mezi významnou skupinu proteinů, které specificky interagují s různými monosacharidy či oligosacharidy. Jsou schopny rozpoznat i nepatrné rozdíly v sacharidové struktuře a hrají tak klíčovou roli v mnoha biologických procesech. Klíšťata se řadí mezi významné parazity, kteří přenáší různá onemocnění. Předpokládá se, že lektiny jsou u klíšťat součástí jejich vrozené imunity, zároveň však mohou být zapojeny do přenosu patogenů klíšťaty. Tato práce se věnuje charakterizaci hypotetického lektinu IrCLec z klíštěte Ixodes ricinus, jehož blízký homolog HlCLec hraje významnou roli v obraně vůči gramnegativním bakteriím. Pomocí bioinformatických nástrojů proběhla analýza sekvence IrCLec, byla predikována jeho struktura, funkce a potenciální ligandy jednotlivých vazebných míst.

Abstract:

Lectins belong to an important group of proteins that specifically interact with various monosaccharides and oligosaccharides. They are able to recognize even slight changes in carbohydrate structure and play crucial role in many biological processes. Ticks are classified as significant parasites that transmit various diseases. Lectins are believed to be part of innate immunity system in ticks and can be involved in tick-borne pathogen transmission as well. This thesis focuses on characterization of the hypothetical lectin IrCLec from the tick Ixodes ricinus whose homolog HlCLec plays an important role in the defense against gram-negative bacteria. Bioinformatic tools were used to analyze the IrCLec sequence, predict its structure, function and potential ligands for each binding site.

Klíčová slova

Ixodes ricinus, klíště, lektin, IrCLec, ticks, lectin

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2019

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 11. 6. 2019
• Vedoucí: Mgr. Lenka Malinovská, Ph.D., prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biochemie / Chemoinformatika a bioinformatika