Analýza výskytu genetických změn androgenového receptoru ve vzorcích tekuté biopsie pacientů s pokročilým karcinomem prostaty

Radka SPURNÁ

Bakalářská práce

Analysis of the genetics changes of androgen receptor in liquid biopsy samples of patients with advanced prostate cancer

Anotace:

Tekutá biopsie je neinvazivní metoda umožňující analýzu cirkulující nebuněčné nádorové DNA z tělních tekutin (především z krevní plazmy) a tím sledovat progresi nádorových onemocnění. Bakalářská práce se zabývá optimalizací analýzy mutací H875Y a T878A genu pro androgenový receptor a variability počtu kopií (CNV) tohoto genu. Pro praktickou část byly využity buněčné linie LNCaP, CWR22rv1, LAPC-4, VCaP pro ověření specifity a citlivosti PCR reakce. Pro detekci mutací a amplifikací androgenového receptoru byla použita kvantitativní PCR, nanodestičková digitální PCR a kapičková digitální PCR. Následně byla provedena analýza 46 vzorků tekuté biopsie od pacientů s pokročilým karcinomem prostaty a 15 vzorků mužů bez nádorového onemocnění jako kontroly. Deset pacientských vzorků bylo pozitivních na CNV genu pro androgenový receptor (21,74 %) a data byla ověřena s využitím dvou systému pro digitální PCR.

Abstract:

Liquid biopsy is a non-invasive method that allows the analysis of circulating non-cellular tumour DNA from body fluids (mainly blood plasma) to monitor cancer progression. The bachelor thesis deals with the optimization of the analysis of H875Y and T878A mutations of the androgen receptor gene and copy number variability (CNV) of this gene. For the practical part, LNCaP, CWR22rv1, LAPC-4, VCaP cell lines were used to verify the specificity and sensitivity of the PCR reaction. Quantitative PCR, nanoplate digital PCR and droplet digital PCR were used to detect mutations and amplifications of the androgen receptor. Subsequently, 46 liquid biopsy samples from patients with advanced prostate cancer and 15 samples from men without cancer as controls were analyzed. Ten patient samples were positive for CNV androgen receptor gene (21.74%) and the data were verified using two digital PCR systems.

Klíčová slova

tekutá biopsie, androgenový receptor, karcinom prostaty, kapičková digitální PCR, nanodestičková digitální PCR

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 9. 5. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Eva Szczyrbová

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie