Implementace analýzy sekvenačních dat PDX modelů v prostředí Galaxy – Bc. Boris Jurič
Bc. Boris Jurič
Bakalářská práce
Implementace analýzy sekvenačních dat PDX modelů v prostředí Galaxy
Implemantation of PDX model sequencing data analysis in Galaxy
Anotace:
Táto práca pojednáva o analýze molekulárnych dát získaných z PDX (Patient Derived Xenograft) modelov. Časť práce vysvetlí, ako sa workflow pre dáta odvodené z PDX líšia od tradičných workflow a ukáže príklady takýchto workflow implementovaných v prostredí Galaxy.Abstract:
This thesis discusses the analysis of molecular data obtained from PDX (Patient Derived Xenograft) models. Part of the work will explain how workflows for PDX derived data differ from traditional workflows and show examples of such workflows being implemented in Galaxy project environment.
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 20. 5. 2022
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/c31h1/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 15. 6. 2022
- Vedoucí: Mgr. Aleš Křenek, Ph.D.
- Oponent: doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D.
Citační záznam
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasarykova univerzita
Přírodovědecká fakultaBakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Bioinformatika
Práce na příbuzné téma
-
Bioinformatics methods to connect the methylation data from profiling microarrays and next-generation sequencing
Siarhei Paliavoi -
Software for the detection of strand bias from the next-generation sequencing data
Alexandra Skysľaková -
Estimating the copy-number of chromosomes using next-generation sequencing data
Peter Guman -
Nová generace sekvenování (Next generation sequencing; NGS) v molekulární diagnostice arytmogenních onemocnění
Iva Synková -
Analýza panelu genů modifikujících průběh onemocnění cystické fibrózy pomocí technologie Nová generace sekvenování (Next generation sequencing; NGS)
Jan Tuček -
Metoda Next Generation Sequencing (NGS) a její využití v laboratoři klinické genetiky
Tereza Žáková -
Multiplexní amplifikace specifických cílových sekvencí a jejich následné resekvenování za využití platformy sekvenování nové generace (next-generation sequencing, NGS), aplikace v molekulárně genetické diagnostice cystické fibrózy
Marie Kývalová -
Implementácia TES API pre Galaxy Pulsar
Norbert Dopjera