Evoluce genomů v tribu Camelineae (brukvovité)

Bc. Martin Polák

Diplomová práce

Genome evolution in the tribe Camelineae (Brassicaceae)

Anotace:

Tribus Camelineae je podskupinou významné rostlinné čeledi brukvitých (Brassicaceae). Přestože obsahuje nejvýznamnější rostlinný modelový druh Arabidopsis thaliana, je většina zástupců tohoto tribu málo prozkoumána. U Brassicaceae, jako u jedinné rostlinné čeledi, je naštěstí úspěšně zavedena metoda srovnávacího malování chromozomů (CCP). Tato metoda nám umožnuje u zkoumaných druhů poodhalit pravděpodobnou evoluci jejich genomů. V této diplomové práci jsou představeny karyotypy čtyř druhů z tribu Camelineae rekonstruované na základě výsledků CCP. Tyto karyotypy byly porovnávány s ancestrálním karyotypem brukovitých (ACK). Studium struktury těchto karyotypů odhaluje směry, kterými se ubírá evoluce chromozomů u zástupců tribu Camelineae.

Abstract:

Tribe Camelineae belongs to the important plant family of crucifers (Brassicaceae). Although it includes the most important model plant organism Arabidopsis thaliana, the most of the tribe’s species remain practically unexamined. Brassicaceae is the only plant family for which the method of comparative chromosomal painting (CCP) is feasible in large scale. This method is used to unveil a probable genome evolution for investigated speices. In this diploma thesis, karyotype structures of four Camelineae species are introduced as they were reconstructed with CCP. These were compared with the Ancestral Crucifer Karyotype (ACK). Analysis of the karyotype structures provides possible directions of the chromosome evolution in the tribe Camelineae.

Keywords

brukvovité, Brassicaceae, Camelineae, evoluce, srovnávací malování chromozomů, struktura karyotypu, genom, ancestrální karyotyp brukvovitých, crucifers, evolution, comparative chromosomal painting, CCP, genome, karyotype structure, ancestral crucifer karyotype, BAC

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 10. 5. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 4. 6. 2018
• Vedoucí: RNDr. Terezie Mandáková, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Zdeněk Kubát, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Experimentální biologie / Molekulární biologie a genetika