Telomeric DNA sequences in beetle taxa vary with species richness

Bc. Daniela PRUŠÁKOVÁ

Rigorózní práce

Abstract:

(TTAGG)n sequence is an ancestral common telomere motif in insects, yet not ubiquitous, especially in beetle lineage. This study indicates that this sequence has been repeatedly lost and replaced by two known alternative telomeric motifs, the (TCAGG)n and (TTAGGG)n, or other unknown alternatives. (TTGGG)n found in one taxa has been proposed as a novel candidate sequence. However, telomeric motifs in many other beetle species remain still undiscovered. Taken together, our extensive mapping of telomeric motifs showed that the diversity is positively related to the species richness of taxa, regardless of the age of the taxa.

Abstract:

(TTAGG)n je běžnou telomerickou sekvencí u hmyzu, ale není univerzální, což platí zejména u brouků. Tato studie ukazuje, že tato sekvence byla opakovaně ztracena a nahrazena buďto dvěma známými alternativními telomerickými sekvencemi, (TCAGG)n a (TTAGGG)n, nebo zcela jinými neznámými alternativami. Sekvence (TTGGG)n nalezená v jednom taxonu brouků byla navržena jako nová kandidátní sekvence. Telomerické motivy u mnoha dalších druhů brouků však zůstávají neobjevené. Celkově naše rozsáhlé mapování telomerických motivů ukázalo, že diverzita pozitivně koreluje s druhovou bohatostí taxonů bez ohledu na stáří taxonů.

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 4. 2022

Obhajoba závěrečné práce

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Přírodovědecká fakulta

Rigorózní řízení / obor:
Biologie / Klinická biologie