Příprava a produkce dvou rekombinantně upravených genů z řasovky Pythium oligandrum v produkční bakterii Escherichia coli s využitím technologie syntetických genů.

Mgr. Marie Mądrzyk

Bachelor's thesis

Preparation and production of two recombinantly modified genes from Oomycete Pythium oligandrum in Escherichia coli using the technology of synthetic genes.

Abstract:

Onemocnění ústní dutiny v podobě zánětu parodontu nebo zubních kazů je rozšířeným jevem, který má více příčin. U obou patogenních stavů lze však najít společný rys, a tím je porušení dynamické rovnováhy v ústní dutině, jiným slovem dysbióza. Mikroorganismy podílející se na vzniku onemocnění jsou součástí biofilmu, který jim poskytuje zvýšenou ochranu před účinky mikrobicidních látek, antibiotik nebo obrannou reakcí imunitního systému. Rozrušení bakteriálního biofilmu se v dnešní době věnuje velká pozornost, protože rozptýlené buňky jsou mnohem citlivější na působení antimikrobiálních látek. Česká firma BARD se zabývá produkci organismu Pythium oligandrum, který vykazuje pozoruhodné mykoparazitické vlastnosti a je využíván v pěstitelství, chovatelství, v domácnostech nebo kosmetických přípravcích. Jeho enzymatický potenciál však přesahuje oblast pouhého antimykotického přípravku a firma by ráda využila jeho účinků pro odstranění zubního plaku a orálního biofilmu. Tato bakalářská práce je ve své praktické části zaměřena na přípravu dvou proteáz pocházejících z P. oligandrum pomocí technologie syntetických genů. Práce se zabývá bioinformatickou analýzou obou proteinů, jejich klonováním, produkcí a následnou purifikací

Abstract:

Disease of the oral cavity in the form of dental caries and periodontitis are widespread phenomena that have multiple causes. Both pathogenic states have one common feature which is the disruption in the dynamic equilibrium of the mouth, called dysbiosis. Microorganisms responsible for the outbreak of the disease are part of a layer, called biofilm, that provides an increased protection against microbicides, antibiotics and the immune system. Nowadays attention is focused on dispersal of the bacterial biofilm because planktonic cells are far more sensitive to the effects of antimicrobials. The Czech company, BARD, produces the organism Pythium oligandrum, which shows remarkable mycoparasitic properties. It is used in farming, breeding, household and cosmetic products. Its enzymatic potential is applicable beyond antimycotics and the company would like to use its effects for dental plaque and oral biofilm removal. This thesis focuses on the preparation of two proteases from P. oligandrum with the help of synthetic genes. The work deals with the bioinformatics analysis of both proteins, their cloning, production and subsequent purification.

Keywords

Pythium oligandrum, Enzymová terapie, Proteázy, Biofilm, Syntetický gen, Enzyme therapy, Proteases, Synthetic gene

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 4. 1. 2018

Thesis defence

• Date of defence: 13. 2. 2018
• Supervisor: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D.
• Reader: Ing. Blanka Pekárová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biochemistry / Biochemistry