Metody detekce genových variant ovlivňujících účinek statinů

Bc. Kateřina BEIEROVÁ

Master's thesis

Methods for detecting gene variants affecting the effect of statins

Anotácia:

Statiny jsou léky, které snižují hladinu cholesterolu v krvi. Blokují syntézu cholesterolu v játrech a užívají se při prevenci kardiovaskulárních onemocnění. Nejčastějším vedlejším účinkem terapie statiny jsou svalové obtíže - myopatie. Mimo dalších faktorů jsou pro vznik statinových myopatií klíčové genetické predispozice. Genotypizace variant genů asociovaných se statinovými myopatiemi umožňuje individuální přístup při terapii a rovněž umožňuje snížit riziko vzniku těchto komplikací. Teoretická část diplomové práce se věnuje ischemické chorobě srdeční, dále biosyntéze cholesterolu a její regulaci. V následujících kapitolách jsou popsány jak statiny, tak metody objevování a genotypizace jednonukleotidových polymorfismů se zaměřením na technologii MassArray. Cílem experimentální části byla genotypizace jednonukleotidových polymorfismů genů SLCO1B1 (rs4149056), GATM (rs9806699) a LILRB5 (rs12975366) u pacientů s ischemickou chorobou srdeční. V porovnání s publikovanými výsledky nebyl zaznamenán význačný rozdíl v genotypových, alelických a fenotypových frekvencích u polymorfismů rs4149056 a rs9806699. Frekvence alely T u polymorfismu rs12975366 byla 49 %, tzn. nižší, než byla předpokládaná frekvence. Genotypizace těchto polymorfismů může usnadnit identifikaci pacientů, kteří mají predispozice ke statinovým myopatiím.

Abstract:

Statins are medicaments that reduce cholesterol levels in blood. They block the synthesis of cholesterol in liver and are used as a prevention of cardiovascular diseases. The most common side effect of statin therapy is muscular weakness - myopathy. Apart from other factors, genetic predispositions are the crucial source of statin-induced myopathy. Genotyping of the individual genetic variants associated with statin-induced myopathies enables an individual approach within the therapy and helps reduce the risk of its formation. In the theoretical part of this thesis I discuss the definition of the ischemic heart disease, cholesterol biosynthesis and its regulation. In the following chapters, statins and methods for detecting and genotyping of single-nucleotide polymorphisms are discussed with focus on the MassArray technology. The aim of the subsequent experiment is to carry out the genotyping of single-nucleotide polymorphisms of the following genes: SLCO1B1 (rs4149056), GATM (rs9806699) and LILRB5 (rs12975366) by patients with ischemic heart disease. With respect to the published results, no significant variation of genotype, allelic or phenotype frequencies of rs4149056 and rs9806699 polymorphisms was found. The frequency of the T-allele of rs12975366 polymorphism was 49 %, e.g. lower that the expected frequency. Genotyping of these polymorphisms could enable easier identification of patients with predispositions for statin-induced myopathies.

Kľúčové slová

ischemická choroba srdeční, statiny, statinová myopatie, jednodnukleotidový polymorfismus, MassArray

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 30. 4. 2019

Obhajoba závěrečné práce

• Vedúci: Mgr. Veronika Žižková

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biology / Molecular and Cell Biology