Efekty dynamických riboregulátorů na zpracování signálů při genové expresi prokaryot

Hynek KASL

Bakalářská práce

Effects of dynamic riboregulators on signal processing in prokaryotic gene expression

Abstract:

It is well known that non-coding RNA sequences play an important role in transcriptional and translational regulatory networks. Simple one-step activation/inhibition methods are well documented in literature. The purpose of this project is to explore dynamic properties of translational regulation based on recurrent RNA hybridization with the 5' untranslated mRNA regions. It is hypothesized that RNA-based regulation exhibits dynamics with important proofreading functions and mechanisms of cooperativity.

Abstract:

Je známe, že nekódující RNA hrají významnou roli v regulaci transkripce a translace v genetických sítích. Jednoduché jednokrokové mechanismy aktivace/inhibice jsou dobře zdokumentované v literatuře. Cílem tohoto projektu je prozkoumat dynamické vlastnosti regulace translace používající opakované hybridizace RNA s oblastí 5'UTR mRNA. Je předpokládáno, že takovýto typ regulace vykazuje dynamiku vhodnou v proofreading mechanismech a podobnou mechanismům kooperativity.

Keywords

regulace translace, matematické modelování, numerická optimalizace, small RNA, syntetická biologie, buněčná kybernetika

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 5. 2014

Zveřejnit od: 31. 12. 2999

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Daniel Georgiev, PhD.

ZÁPADOČESKÁ UNIVERZITA V PLZNI

Fakulta aplikovaných věd

Bakalářský studijní program / obor:
Aplikované vědy a informatika / Kybernetika a řídicí technika