Charakterizace potomstev rodičů nesoucích B chromozóm u planého čiroku (Sorghum purpureosericeum)

Zdena KAŠPAROVÁ

Bachelor's thesis

Characterization of the offspring of parents carrying the B chromosome in wild sorghum (S. purpureosericeum)

Abstract:

Sorghum purpureosericeum je jedním z planých druhů rodu Sorghum, u kterého se nad rámec standardního chromozómového komplementu vyskytují i tzv. B chromozómy. Tyto nadbytečné elementy vykazují nepravidelnou dědičnost a obecně vysokou míru polymorfismu. V rámci jednoho druhu tak většinou existuje více typů B chromozómů. U planých čiroků komplikuje studium těchto nadbytečných chromozómů i výrazná míra cizosprašnosti, která udržuje výraznou heterogenitu celého genomu. Cílem předkládané práce byla charakterizace potomstev čtyř linií rodičů nesoucích ve svém genomu 1 B chromozóm za účelem určení míry cizosprašnosti. Typ B chromozómu byl u potomků stanoven na základě přítomnosti/absence dvou B-specifických PCR markerů CL115 a CL168. Odlišný vzor přítomnosti markerů mezi rodičem a jeho potomky pak poukazoval na možné cizosprášení. Z celkově analyzovaných 49 jedinců, sedm mělo jiný typ B chromozómu než původní rodič. Z toho lze usoudit, že k opylení pylem z jiné rostliny dochází přibližně ve 14 % případů.

Abstract:

Sorghum purpureosericeum is one of the wild species of the genus Sorghum carrying so-called B chromosomes in addition to A complement. These supernumerary elements are passed irregularly to the progeny and have typically high degree of polymorphism. Generally, there are more B chromosome forms described in one species. Moreover, the study of the B chromosomes of wild sorghums is burden by significant level of cross-pollination, which continuously maintain the genome heterogeneity. The aim of this thesis was to characterize four offspring lines of parents carrying the 1 B chromosome in their genome with respect to the frequency of cross-pollination. The type of the B chromosome in the offspring was determined based on the presence/absence of the two markers pattern CL115 and CL158. Marker pattern different from the parent may result from pollination with the pollen of the other than parent plant. Among the 49 individuals tested, seven did not match to the parents. These results suggest that cross-pollination may occur with frequency approximately 14 %.

Keywords

Sorghum purpureosericeum, B chromozómy, DNA markery, PCR, průtoková cytometrie

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 3. 5. 2022

Thesis defence

• Supervisor: Mgr. Miroslava Karafiátová, Ph.D.

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biology / Molecular and Cell Biology