Mobilní aplikace pro vizualizaci molekul

Bc. Marek Maruška

Diplomová práce

Mobile application for molecular visualization

Anotace:

Táto práca sa zameriava na vizualizáciu proteinových štruktúr a ich tunelov na prenosných zariadeniach. Najprv popisujeme existujúce aplikácie, ktoré zobrazujú proteinové štruktúry, následne predstavíme vlastnú implementáciu pre platformu android. Naša aplikácia umožňuje užívateľovi zobraziť molekuly pomocou štandardných vizualizačných modelov, ako napr. "balls and sticks" a "secondary structures" a je takisto schopná vykresliť tunely predpočítané aplikáciou CAVER Analyst.

Abstract:

This thesis focuses on visualization of protein structures and their tunnels on portable devices such as smartphones and tablets. First we describe the existing applications that visualize protein structures, then we introduce our own implementation for Android platform. Our application enables the user to visualize molecules using standard visualization models, e.g., balls and sticks, secondary structures, and is also capable of rendering tunnels precomputed by CAVER Analyst.

Keywords

protein, secondary structure, tunnel, visualization, CAVER Analyst, sekundárna štruktúra, tunel, vizualizácia

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 31. 5. 2016

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 28. 6. 2016
• Vedoucí: doc. RNDr. Barbora Kozlíková, Ph.D.
• Oponent: RNDr. Adam Jurčík, Ph.D.

Masarykova univerzita

Fakulta informatiky

Magisterský studijní program / obor:
Informatika / Počítačová grafika